More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2906 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  672    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  79.7 
 
 		 335 aa  531  1e-150  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  75.45 
 
 		 338 aa  484  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  75.45 
 
 		 338 aa  484  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  75.45 
 
 		 338 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2767  ATPase  68.96 
 
 		 335 aa  436  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  66.04 
 
 		 333 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  62.04 
 
 		 335 aa  415  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  64.49 
 
 		 349 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  61.42 
 
 		 335 aa  408  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  66.56 
 
 		 336 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  62.84 
 
 		 334 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  61.04 
 
 		 335 aa  408  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.84 
 
 		 333 aa  407  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.81 
 
 		 334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  62.01 
 
 		 332 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  63.24 
 
 		 332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  63.41 
 
 		 333 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1295  ATPase  62.19 
 
 		 334 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.962935  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3251  ATPase  61.51 
 
 		 346 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  62.81 
 
 		 332 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  61.76 
 
 		 342 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.54 
 
 		 350 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  63.55 
 
 		 333 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  67.11 
 
 		 336 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.56 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  63.81 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  60.94 
 
 		 337 aa  394  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  62.62 
 
 		 337 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.5 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  63.81 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  62.31 
 
 		 340 aa  391  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  66.78 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.77 
 
 		 336 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  56.39 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  63.61 
 
 		 362 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  64.8 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  50.47 
 
 		 317 aa  340  2.9999999999999998e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  51.27 
 
 		 317 aa  326  3e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 		 320 aa  317  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51 
 
 		 308 aa  311  6.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  52.68 
 
 		 338 aa  311  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.97 
 
 		 327 aa  311  6.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.07 
 
 		 341 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  49.69 
 
 		 343 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.77 
 
 		 341 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  48.34 
 
 		 321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.52 
 
 		 334 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 		 349 aa  305  7e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.51 
 
 		 334 aa  305  8.000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.74 
 
 		 320 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52 
 
 		 379 aa  303  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  46.75 
 
 		 356 aa  295  9e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.65 
 
 		 345 aa  294  1e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.04 
 
 		 356 aa  293  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.65 
 
 		 351 aa  292  5e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.82 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  45.19 
 
 		 324 aa  290  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  45.31 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.48 
 
 		 338 aa  282  5.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.59 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.52 
 
 		 341 aa  279  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.71 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.9 
 
 		 313 aa  268  1e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.37 
 
 		 333 aa  267  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  43.67 
 
 		 339 aa  265  8e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  44.33 
 
 		 324 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  46.18 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.99 
 
 		 334 aa  260  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.85 
 
 		 333 aa  260  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  44.55 
 
 		 318 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  41.39 
 
 		 334 aa  255  9e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  41.69 
 
 		 334 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  47.92 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.13 
 
 		 331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  40.06 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  42.32 
 
 		 320 aa  242  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  45.05 
 
 		 318 aa  242  7e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  44.58 
 
 		 347 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1787  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.11 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000466383  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  39.33 
 
 		 340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  39.74 
 
 		 315 aa  239  5e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.57 
 
 		 331 aa  239  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  44.83 
 
 		 353 aa  238  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  40.53 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  38.96 
 
 		 325 aa  237  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  39.81 
 
 		 332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  42.72 
 
 		 333 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.57 
 
 		 324 aa  235  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.72 
 
 		 342 aa  235  7e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  39.87 
 
 		 328 aa  235  8e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  41.07 
 
 		 335 aa  235  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2518  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.76 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.9 
 
 		 354 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3413  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.57 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.48 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4891  hypothetical protein  41.07 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  43.22 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  44.16 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1170  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.58 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>