More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2834 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2834  putative virulence factor  100 
 
 		 534 aa  1015    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00622591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  61.16 
 
 		 513 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  61.47 
 
 		 513 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  61.09 
 
 		 513 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  60.34 
 
 		 514 aa  575  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  61.57 
 
 		 543 aa  567  1e-160  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0445  integral membrane protein MviN  60.41 
 
 		 515 aa  540  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  48.22 
 
 		 512 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3023  integral membrane protein MviN  44.53 
 
 		 514 aa  358  9.999999999999999e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4034  integral membrane protein MviN  45.59 
 
 		 528 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  41.74 
 
 		 529 aa  344  2.9999999999999997e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  40.26 
 
 		 528 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  40.26 
 
 		 526 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  41.56 
 
 		 555 aa  324  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  41.37 
 
 		 529 aa  322  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  42.07 
 
 		 535 aa  316  9e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  0.0000209824 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0425  integral membrane protein MviN  43.61 
 
 		 532 aa  313  5.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  39.89 
 
 		 520 aa  310  5e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3538  virulence factor MVIN-like  43.46 
 
 		 513 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.32091  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  42.42 
 
 		 525 aa  294  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  41.57 
 
 		 509 aa  282  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  40.3 
 
 		 522 aa  281  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  41.57 
 
 		 509 aa  281  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4498  integral membrane protein MviN  41.65 
 
 		 508 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0587  integral membrane protein MviN  41.2 
 
 		 523 aa  275  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.354322  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1019  integral membrane protein MviN  45.73 
 
 		 510 aa  269  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  40.6 
 
 		 529 aa  269  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  38.22 
 
 		 522 aa  262  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2014  integral membrane protein MviN  43.47 
 
 		 525 aa  258  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  41.46 
 
 		 495 aa  256  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3497  integral membrane protein MviN  41.35 
 
 		 509 aa  254  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319117  normal  0.680185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0011  integral membrane protein MviN  39.21 
 
 		 518 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0453851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  36 
 
 		 518 aa  249  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  37.74 
 
 		 522 aa  245  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5900  integral membrane protein MviN  41.12 
 
 		 509 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  33.46 
 
 		 523 aa  243  7e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  34.84 
 
 		 511 aa  243  7.999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  36.26 
 
 		 511 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  33.46 
 
 		 508 aa  240  4e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  36.95 
 
 		 511 aa  240  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  33.52 
 
 		 519 aa  239  6.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  33.7 
 
 		 525 aa  239  8e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  38.99 
 
 		 508 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  34.01 
 
 		 520 aa  239  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  36.36 
 
 		 528 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  32.85 
 
 		 531 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  38.89 
 
 		 522 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  34.74 
 
 		 511 aa  238  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  34.37 
 
 		 524 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  34.37 
 
 		 524 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  34.37 
 
 		 524 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  34.37 
 
 		 524 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  34.37 
 
 		 524 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  35.81 
 
 		 519 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  35.81 
 
 		 519 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  35.81 
 
 		 519 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  36.42 
 
 		 545 aa  236  9e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  36.23 
 
 		 511 aa  236  9e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  35.59 
 
 		 519 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  35.17 
 
 		 517 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  33.71 
 
 		 519 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  35.21 
 
 		 519 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  35.17 
 
 		 517 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  39.9 
 
 		 521 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  36.74 
 
 		 521 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  35.21 
 
 		 519 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  35.41 
 
 		 511 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  35.41 
 
 		 511 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  35.41 
 
 		 511 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  34.07 
 
 		 511 aa  234  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  35.41 
 
 		 511 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1651  integral membrane protein MviN  37.08 
 
 		 509 aa  234  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.330651 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  35.41 
 
 		 511 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  35.08 
 
 		 505 aa  233  6e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  35.23 
 
 		 511 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  35.23 
 
 		 511 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  35.23 
 
 		 511 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  35.23 
 
 		 511 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5302  integral membrane protein MviN  39.96 
 
 		 509 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  30.46 
 
 		 495 aa  233  9e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  37.53 
 
 		 530 aa  232  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  37.66 
 
 		 509 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1078  virulence factor MVIN-like  40.95 
 
 		 508 aa  231  3e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.342174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  32.47 
 
 		 519 aa  231  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  33.78 
 
 		 519 aa  230  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  34.95 
 
 		 512 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  36.29 
 
 		 573 aa  229  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  34.95 
 
 		 512 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  33.21 
 
 		 511 aa  229  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0372  integral membrane protein MviN  40.53 
 
 		 519 aa  229  9e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.23269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  35.39 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  34 
 
 		 511 aa  226  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  35.02 
 
 		 512 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  34.77 
 
 		 519 aa  226  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  33.87 
 
 		 542 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  37.45 
 
 		 545 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1610  integral membrane protein MviN  37.92 
 
 		 534 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  39.73 
 
 		 511 aa  224  4e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  37.39 
 
 		 533 aa  224  4e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1436  integral membrane protein MviN  37.31 
 
 		 509 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>