272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2802 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  100 
 
 		 425 aa  879    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  76.94 
 
 		 420 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  71.05 
 
 		 430 aa  603  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  62.34 
 
 		 425 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  59.76 
 
 		 431 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  62.6 
 
 		 425 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  64.14 
 
 		 440 aa  525  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  62.76 
 
 		 427 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  59.72 
 
 		 430 aa  512  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  53.85 
 
 		 437 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  49.09 
 
 		 453 aa  424  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  50.51 
 
 		 449 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.22 
 
 		 414 aa  385  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  50.9 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  49.74 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0587  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.6 
 
 		 456 aa  381  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.271361  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0801  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.01 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.325021  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  50.13 
 
 		 445 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  47.63 
 
 		 448 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  48.66 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.94 
 
 		 418 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.94 
 
 		 418 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  43.75 
 
 		 445 aa  366  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2631  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  47.75 
 
 		 443 aa  368  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  48.25 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  48.18 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  50 
 
 		 419 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  47.24 
 
 		 457 aa  355  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  47.12 
 
 		 409 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2438  putative sulfite oxidase molybdopterin subunit  44.33 
 
 		 457 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  43.03 
 
 		 437 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  46.58 
 
 		 414 aa  334  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  46.34 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  44.56 
 
 		 423 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  42.96 
 
 		 425 aa  318  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  42.62 
 
 		 419 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  43.82 
 
 		 431 aa  306  3e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.4 
 
 		 425 aa  303  6.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  41.18 
 
 		 431 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  45.43 
 
 		 428 aa  300  3e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  45.43 
 
 		 428 aa  300  3e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  41.65 
 
 		 414 aa  298  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  43.28 
 
 		 406 aa  294  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  43.28 
 
 		 402 aa  293  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  43.84 
 
 		 405 aa  287  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  41.42 
 
 		 415 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  39.14 
 
 		 414 aa  282  9e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  37.88 
 
 		 427 aa  266  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  35.03 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  33.86 
 
 		 338 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.27 
 
 		 416 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  33.98 
 
 		 361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  32.4 
 
 		 401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.69 
 
 		 400 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  29.45 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  31.03 
 
 		 372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  31.58 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  31.58 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  31.74 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.86 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  30.65 
 
 		 369 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  30.79 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  29.66 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  30.22 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  30.22 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  31.78 
 
 		 370 aa  123  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  32.36 
 
 		 414 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  26.91 
 
 		 409 aa  121  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  30.56 
 
 		 407 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  31.6 
 
 		 410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.61 
 
 		 415 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  29.77 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  31.19 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  28.41 
 
 		 349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  29.45 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.57 
 
 		 408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  31.1 
 
 		 410 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  29.5 
 
 		 379 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  28.31 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  31.73 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  27.01 
 
 		 409 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.88 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  32.79 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  33.33 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.79 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  29.73 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  29.36 
 
 		 403 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  29.39 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.45 
 
 		 405 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.22 
 
 		 417 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.79 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.23 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  28.04 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.49 
 
 		 411 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.47 
 
 		 453 aa  106  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  28.69 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  28.53 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  26.59 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  26.59 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  29.28 
 
 		 866 aa  104  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>