74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2675 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  806    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  64.56 
 
 		 392 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  62.77 
 
 		 390 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  65.23 
 
 		 390 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  40.46 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0700  hypothetical protein  38.64 
 
 		 380 aa  249  7e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  0.0832434 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  38.1 
 
 		 379 aa  247  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  36.57 
 
 		 382 aa  246  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3140  hypothetical protein  41.08 
 
 		 387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  37.89 
 
 		 382 aa  246  8e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  35.7 
 
 		 382 aa  244  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  40.82 
 
 		 392 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  40.82 
 
 		 392 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  40.82 
 
 		 384 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  40.82 
 
 		 392 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  40.82 
 
 		 392 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  40.82 
 
 		 392 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2663  hypothetical protein  40.79 
 
 		 387 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  40.58 
 
 		 386 aa  242  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  40.82 
 
 		 384 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2171  hypothetical protein  40.51 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1939  hypothetical protein  39.94 
 
 		 384 aa  237  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  39 
 
 		 386 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  39 
 
 		 386 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  35.9 
 
 		 381 aa  235  8e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3668  hypothetical protein  39.53 
 
 		 385 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432885  hitchhiker  0.00253652 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  38.12 
 
 		 389 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  37.82 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  38.42 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  38.42 
 
 		 398 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  38.37 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  38.94 
 
 		 378 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4519  domain of unknown function DUF1745  39.08 
 
 		 387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317884  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  37.8 
 
 		 385 aa  226  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4193  domain of unknown function DUF1745  40.06 
 
 		 386 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  35.68 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3320  hypothetical protein  39.66 
 
 		 387 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  35.78 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38990  hypothetical protein  39.38 
 
 		 387 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.880326  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  36.27 
 
 		 383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2940  hypothetical protein  38.51 
 
 		 402 aa  213  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  35.88 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2353  hypothetical protein  36.31 
 
 		 393 aa  203  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.18015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  28.77 
 
 		 460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  28.81 
 
 		 368 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  27.91 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  26.5 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  28.49 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5004  chemotaxis sensory transducer  27.14 
 
 		 672 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.71371 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0982  domain of unknown function DUF1745  30.14 
 
 		 666 aa  94  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.505903  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.11 
 
 		 675 aa  93.6  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0690  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 		 1186 aa  89.7  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.87 
 
 		 669 aa  89.7  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2083  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.1 
 
 		 647 aa  83.6  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0223967  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1866  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.32 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  25.98 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  22.86 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  22.71 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  26.05 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  24.08 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  25.78 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  24.44 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  26.05 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  25.14 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  25.15 
 
 		 416 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  24.12 
 
 		 373 aa  53.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  22.61 
 
 		 512 aa  53.1  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  27.52 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  22.75 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  20.63 
 
 		 629 aa  50.8  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  26.26 
 
 		 1101 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  25.95 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  22.66 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  25.11 
 
 		 427 aa  43.1  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>