37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2664 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  775    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  48.63 
 
 		 411 aa  342  7e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  49.04 
 
 		 391 aa  341  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  49.6 
 
 		 408 aa  338  8e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  48.22 
 
 		 397 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  48.39 
 
 		 408 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  50.68 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  47.11 
 
 		 367 aa  326  6e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  47.85 
 
 		 408 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  48.1 
 
 		 420 aa  324  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  43.28 
 
 		 400 aa  320  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  47.61 
 
 		 395 aa  317  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  46.09 
 
 		 427 aa  317  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  44.09 
 
 		 429 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  46.36 
 
 		 429 aa  311  9e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  46.51 
 
 		 393 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  46.87 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  44.15 
 
 		 422 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  44.01 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  44.85 
 
 		 394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  45.58 
 
 		 369 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  39.26 
 
 		 408 aa  300  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  48.16 
 
 		 423 aa  298  9e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  44.08 
 
 		 395 aa  292  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  45.61 
 
 		 410 aa  290  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  41.78 
 
 		 405 aa  287  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  44.15 
 
 		 424 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  44.75 
 
 		 423 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  39.57 
 
 		 412 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  38.91 
 
 		 416 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  39.1 
 
 		 394 aa  209  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  39.12 
 
 		 406 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  40 
 
 		 393 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  39.01 
 
 		 402 aa  186  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  34.85 
 
 		 391 aa  179  9e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  23.57 
 
 		 415 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  22.86 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>