132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2661 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  100 
 
 
176 aa  353  5.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  59.89 
 
 
178 aa  214  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  59.12 
 
 
176 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  59.09 
 
 
176 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  67.31 
 
 
155 aa  196  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2526  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  63.43 
 
 
181 aa  171  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  54.67 
 
 
154 aa  155  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  53.42 
 
 
148 aa  154  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  53.06 
 
 
154 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.93 
 
 
198 aa  148  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.7 
 
 
151 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.05 
 
 
155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.37 
 
 
154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.34 
 
 
153 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.72 
 
 
187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  49.65 
 
 
232 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.31 
 
 
213 aa  143  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.68 
 
 
152 aa  143  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.68 
 
 
148 aa  142  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.58 
 
 
182 aa  141  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.34 
 
 
147 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  48.99 
 
 
213 aa  141  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.75 
 
 
193 aa  140  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.63 
 
 
148 aa  134  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.99 
 
 
156 aa  134  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  48.32 
 
 
161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.2 
 
 
224 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  41.92 
 
 
246 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.67 
 
 
197 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.2 
 
 
224 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.86 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  41.56 
 
 
204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.65 
 
 
157 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.25 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.59 
 
 
243 aa  124  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.52 
 
 
158 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.06 
 
 
158 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.06 
 
 
158 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  41.67 
 
 
151 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.58 
 
 
151 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  44.37 
 
 
150 aa  117  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  44.37 
 
 
150 aa  117  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.34 
 
 
152 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.51 
 
 
208 aa  104  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.95 
 
 
151 aa  96.3  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2185  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  37.88 
 
 
1012 aa  95.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6673  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  37.69 
 
 
1019 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.581747  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2073  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  36.36 
 
 
980 aa  91.3  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576081  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  38.62 
 
 
983 aa  89.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  32.54 
 
 
1011 aa  88.2  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  32.54 
 
 
1011 aa  88.2  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5890  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  31.95 
 
 
1012 aa  85.5  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614012  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  35.37 
 
 
997 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.36 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1874  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.31 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.28 
 
 
241 aa  78.2  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.58 
 
 
220 aa  77  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3296  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  34.69 
 
 
987 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0204451  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2227  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.25 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4723  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  36.73 
 
 
991 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102833  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.17 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.69 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6656  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.03 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1492  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 
216 aa  72  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.619524  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20930  hypothetical protein  31.82 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451934  normal  0.0186523 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5354  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.34 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000000688113  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  28.49 
 
 
1027 aa  66.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1301  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  36.89 
 
 
988 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.648743 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1563  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.35 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0668  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  32.31 
 
 
988 aa  65.1  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295598  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0704  hypothetical protein  26.16 
 
 
253 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.73 
 
 
237 aa  64.3  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3262  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.42 
 
 
253 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234433  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.79 
 
 
241 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.94 
 
 
149 aa  58.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.667187  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0213  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.56 
 
 
154 aa  58.2  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0593  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.92 
 
 
244 aa  58.2  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1231  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  21.38 
 
 
150 aa  57.8  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99571  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.44 
 
 
237 aa  56.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.48 
 
 
222 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.48 
 
 
222 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0483  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.48 
 
 
222 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 
208 aa  55.5  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4415  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.35 
 
 
150 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0474  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.12 
 
 
248 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0413426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  27.54 
 
 
200 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.91 
 
 
225 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0678  hypothetical protein  25.29 
 
 
242 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.32 
 
 
254 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1016  hypothetical protein  25.29 
 
 
242 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  25 
 
 
208 aa  52.4  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  29.2 
 
 
289 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24 
 
 
254 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0608  carbon monoxide dehydrogenase family protein  25.29 
 
 
242 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.802203  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2442  carbon monoxide dehydrogenase family protein  25.29 
 
 
242 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0851  carbon monoxide dehydrogenase family protein  25.29 
 
 
242 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0856  carbon monoxide dehydrogenase family protein  25.29 
 
 
242 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0056  carbon monoxide dehydrogenase family protein  25.29 
 
 
242 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5184  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.57 
 
 
232 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>