76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2461 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  185  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  86.6 
 
 		 100 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  82.83 
 
 		 99 aa  159  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  76.77 
 
 		 99 aa  151  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0368  PAAR repeat-containing protein  78 
 
 		 100 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  75.76 
 
 		 96 aa  141  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  71.72 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  66.67 
 
 		 98 aa  127  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  70.71 
 
 		 96 aa  124  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2816  PAAR repeat-containing protein  69.7 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  65.62 
 
 		 96 aa  120  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3584  PAAR repeat-containing protein  69.05 
 
 		 84 aa  110  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2373  PAAR repeat-containing protein  62.63 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0352022 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  57.84 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  59.38 
 
 		 96 aa  101  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  54.64 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  50.52 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3608  PAAR  48.57 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3826  PAAR repeat-containing protein  51.81 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1907  PAAR repeat-containing protein  50.94 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142709  hitchhiker  0.000734481 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  46.67 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2253  PAAR repeat-containing protein  45.19 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175584  hitchhiker  0.000480373 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1680  PAAR repeat-containing protein  49.5 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  40.21 
 
 		 540 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2551  PAAR repeat-containing protein  49 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  41.84 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1650  hypothetical protein  37.78 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  40.62 
 
 		 466 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5383  PAAR repeat-containing protein  42.45 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4775  PAAR repeat-containing protein  40.74 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  41.67 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0985  hypothetical protein  47.89 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  39.18 
 
 		 481 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  37.76 
 
 		 469 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4633  hypothetical protein  39.58 
 
 		 177 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  37.35 
 
 		 1229 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  41.18 
 
 		 1422 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  36.94 
 
 		 592 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  36.08 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  40.58 
 
 		 1379 aa  48.1  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  42.03 
 
 		 855 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  32.63 
 
 		 379 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  39.08 
 
 		 1437 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0925  PAAR repeat-containing protein  42.99 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3756  hypothetical protein  33.68 
 
 		 386 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  39.18 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  37.18 
 
 		 1475 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  35.63 
 
 		 1446 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  37.11 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  37.18 
 
 		 1457 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  37.5 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  36.49 
 
 		 1423 aa  43.5  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  40.79 
 
 		 1386 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0240  PAAR repeat-containing protein  43.08 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1157  PAAR repeat-containing protein  39.47 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  36.94 
 
 		 456 aa  42  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  39.47 
 
 		 1447 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13390  hypothetical protein  38.54 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.694836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  42.31 
 
 		 1505 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  42.31 
 
 		 1600 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3019  hypothetical protein  32.97 
 
 		 84 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  42.31 
 
 		 1616 aa  41.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  36.04 
 
 		 461 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  37.84 
 
 		 1428 aa  41.2  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1933  hypothetical protein  44.59 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.437676  normal  0.622076 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1487  hypothetical protein  44.59 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1375  hypothetical protein  44.59 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1578  Rhs family protein  44.93 
 
 		 1556 aa  40.8  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883586  normal  0.184607 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1039  PAAR  43.56 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0895  hypothetical protein  43.56 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.457574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2946  PAAR repeat-containing protein  34.51 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  36.04 
 
 		 456 aa  40.4  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  41.43 
 
 		 406 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  50 
 
 		 386 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2610  hypothetical protein  27.84 
 
 		 85 aa  40  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408788  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3238  PAAR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 85 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>