More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2397 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  76.23 
 
 
447 aa  681    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 
447 aa  905    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2725  phosphoglucosamine mutase  72.48 
 
 
447 aa  640    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.949023  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  73.03 
 
 
447 aa  661    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  76.23 
 
 
447 aa  682    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  76.23 
 
 
447 aa  686    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  73.15 
 
 
447 aa  654    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  62.19 
 
 
445 aa  550  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  61.88 
 
 
452 aa  542  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  60.45 
 
 
450 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  60 
 
 
450 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  62.14 
 
 
452 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  61.66 
 
 
448 aa  540  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  61.07 
 
 
451 aa  540  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  60.99 
 
 
445 aa  536  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  61.8 
 
 
444 aa  532  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  62.88 
 
 
446 aa  525  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  62.41 
 
 
446 aa  525  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  62.92 
 
 
456 aa  526  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  62.41 
 
 
446 aa  525  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  61.95 
 
 
446 aa  522  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  59.51 
 
 
451 aa  523  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  59.51 
 
 
451 aa  523  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  59.78 
 
 
448 aa  521  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  60.31 
 
 
466 aa  522  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  59.33 
 
 
448 aa  520  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  59.28 
 
 
459 aa  520  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  60.18 
 
 
465 aa  519  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4597  phosphoglucosamine mutase  59.33 
 
 
448 aa  519  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  59.1 
 
 
449 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  61.48 
 
 
446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  61.15 
 
 
447 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  59.1 
 
 
450 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  59.42 
 
 
449 aa  515  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  57.75 
 
 
450 aa  514  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  59.33 
 
 
450 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  56.03 
 
 
460 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  60.28 
 
 
450 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  58.43 
 
 
450 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  57.14 
 
 
451 aa  493  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  56.61 
 
 
454 aa  491  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  56.73 
 
 
451 aa  484  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  56.24 
 
 
452 aa  488  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  56.5 
 
 
454 aa  486  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  55.38 
 
 
454 aa  487  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0777  phosphoglucosamine mutase  56.7 
 
 
449 aa  485  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0601478 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  58.3 
 
 
483 aa  486  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  55.06 
 
 
453 aa  485  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  55.16 
 
 
451 aa  483  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  54.48 
 
 
450 aa  482  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  55.83 
 
 
450 aa  474  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  52.58 
 
 
449 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1723  phosphoglucosamine mutase  53.85 
 
 
450 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822287  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  56.32 
 
 
496 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  54.02 
 
 
450 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  56.32 
 
 
496 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  54.81 
 
 
450 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  55.28 
 
 
469 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  56.82 
 
 
458 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  51.8 
 
 
445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  55.56 
 
 
450 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3604  phosphoglucosamine mutase  52.11 
 
 
454 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  hitchhiker  0.000672034 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0985  phosphoglucosamine mutase  51.91 
 
 
445 aa  442  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000240064  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2839  phosphoglucosamine mutase  51.13 
 
 
445 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000184945  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3065  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 
445 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3422  phosphoglucosamine mutase  50.9 
 
 
445 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000143803  decreased coverage  0.000132803 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1002  phosphoglucosamine mutase  50.79 
 
 
445 aa  437  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0206827  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3566  phosphoglucosamine mutase  51.4 
 
 
445 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  hitchhiker  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1021  phosphoglucosamine mutase  51.35 
 
 
445 aa  438  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107828  hitchhiker  0.000573147 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  50.55 
 
 
450 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1086  phosphoglucosamine mutase  51.35 
 
 
445 aa  438  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00718811  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 
450 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3244  phosphoglucosamine mutase  50.9 
 
 
445 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000220965  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1025  phosphoglucosamine mutase  51.13 
 
 
445 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0055133  hitchhiker  0.0000634577 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3394  phosphoglucosamine mutase  50.7 
 
 
443 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000763461  hitchhiker  0.000140936 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1199  phosphoglucosamine mutase  50.9 
 
 
445 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3285  phosphoglucosamine mutase  50.79 
 
 
445 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526752  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1123  phosphoglucosamine mutase  50.79 
 
 
445 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000138646  unclonable  0.0000000000053894 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2832  phosphoglucosamine mutase  50.59 
 
 
443 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011182  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 
450 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4185  phosphoglucosamine mutase  49.22 
 
 
447 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 
450 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  50.67 
 
 
451 aa  428  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1487  phosphoglucosamine mutase  50.44 
 
 
450 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152305  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  49.44 
 
 
445 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0814  phosphoglucosamine mutase  48.64 
 
 
444 aa  425  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000566204  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  49.77 
 
 
447 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  52.13 
 
 
455 aa  427  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3469  phosphoglucosamine mutase  50.79 
 
 
445 aa  428  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4495  phosphoglucosamine mutase  49.1 
 
 
447 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.235157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3589  phosphoglucosamine mutase  51.35 
 
 
445 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3483  phosphoglucosamine mutase  51.35 
 
 
445 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0848624  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2774  phosphoglucosamine mutase  50.69 
 
 
452 aa  421  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322399  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5469  phosphoglucosamine mutase  49.22 
 
 
445 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2670  phosphoglucosamine mutase  51.67 
 
 
446 aa  422  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2021  phosphoglucosamine mutase  50.88 
 
 
451 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3553  phosphoglucosamine mutase  51.35 
 
 
445 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3651  phosphoglucosamine mutase  51.35 
 
 
445 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3483  phosphoglucosamine mutase  51.35 
 
 
445 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0636  phosphoglucosamine mutase  46.4 
 
 
445 aa  419  1e-116  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.605562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>