More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2351 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  654    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  68.21 
 
 		 323 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  66.77 
 
 		 318 aa  401  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  68.52 
 
 		 323 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  59.44 
 
 		 342 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  47.34 
 
 		 376 aa  282  6.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  48.65 
 
 		 340 aa  280  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  45.85 
 
 		 316 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  44.35 
 
 		 388 aa  266  4e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  46.77 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  46.77 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  72.57 
 
 		 176 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  56 
 
 		 225 aa  232  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  42.86 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  44.92 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  40.82 
 
 		 366 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  55.36 
 
 		 242 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  54.71 
 
 		 242 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  41.09 
 
 		 373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  40.29 
 
 		 373 aa  208  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  37.54 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  39.64 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  37.28 
 
 		 386 aa  202  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  42.25 
 
 		 357 aa  202  9e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  39.89 
 
 		 386 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  39.32 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  39.32 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  54.37 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  38.89 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  50.92 
 
 		 230 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  50.91 
 
 		 233 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  36.86 
 
 		 345 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  36.77 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  47.98 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  40.29 
 
 		 363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  50 
 
 		 233 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  48.87 
 
 		 234 aa  196  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  38 
 
 		 374 aa  196  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  39.6 
 
 		 372 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  37.92 
 
 		 369 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  39.3 
 
 		 390 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  51.38 
 
 		 233 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  37.3 
 
 		 341 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  38.51 
 
 		 342 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  35.96 
 
 		 340 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  49.54 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  49.08 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  47.98 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  36.66 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  49.55 
 
 		 233 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  36.98 
 
 		 341 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  39.76 
 
 		 381 aa  190  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  36.98 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  40.41 
 
 		 380 aa  189  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  38.66 
 
 		 385 aa  189  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  35.87 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  36.66 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  37.3 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  32.94 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  37.3 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  39.43 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  35.85 
 
 		 343 aa  185  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  36.98 
 
 		 342 aa  185  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  35.85 
 
 		 343 aa  185  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3469  xanthine dehydrogenase accessory factor  53.73 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  36.51 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  36.66 
 
 		 341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  36.66 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  36.66 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  37.62 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  38.36 
 
 		 398 aa  183  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  36.66 
 
 		 341 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  40 
 
 		 312 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  36.87 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  36.33 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  36.33 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  37.9 
 
 		 389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  39.31 
 
 		 329 aa  180  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  60.13 
 
 		 228 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  37 
 
 		 315 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  35.67 
 
 		 372 aa  179  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  35.69 
 
 		 397 aa  179  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  54.8 
 
 		 228 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1293  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  50 
 
 		 235 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126009  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  36.71 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  37.3 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  35.74 
 
 		 357 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  38.94 
 
 		 368 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1565  protein of unknown function DUF182  38.12 
 
 		 402 aa  175  9e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  35.96 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1934  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  69.23 
 
 		 133 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0140126  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  36.99 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0970  hypothetical protein  50 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  35.35 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6028  hypothetical protein  45.05 
 
 		 231 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  34.89 
 
 		 333 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  35.96 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  35.55 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  36.51 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  40.49 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>