More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2339 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  100 
 
 		 75 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  66.18 
 
 		 78 aa  94.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  55.71 
 
 		 80 aa  84  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  48 
 
 		 75 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  48 
 
 		 101 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  43.28 
 
 		 74 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  46.27 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  42.03 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  41.79 
 
 		 74 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  43.48 
 
 		 77 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  55.22 
 
 		 74 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  40.54 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  43.48 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  41.89 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  47.06 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0904  SirA family protein  44.78 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.849606  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  41.56 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2705  SirA family protein  43.42 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  37.14 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  46.03 
 
 		 76 aa  64.7  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  39.19 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  39.71 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  42.65 
 
 		 72 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  44.12 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0978  SirA family protein  46.58 
 
 		 80 aa  63.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0114244 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  41.1 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  37.14 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  39.19 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  39.19 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  37.84 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  36.49 
 
 		 75 aa  62  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  40.54 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4368  SirA family protein  41.67 
 
 		 82 aa  62  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  36.49 
 
 		 75 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3534  SirA family protein  41.89 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724974  decreased coverage  0.000159335 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  36.49 
 
 		 75 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  36.49 
 
 		 75 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  38.81 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  45.59 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  36.49 
 
 		 75 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  36.49 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3548  SirA family protein  47.06 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.379024  normal  0.567232 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  39.19 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  36.49 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  38.46 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  42.03 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  36.49 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  36.49 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  44.44 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  42.65 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  39.44 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  37.84 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  42.65 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  35.14 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  37.68 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  44.12 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  42.03 
 
 		 70 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  44.26 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7291  SirA family protein  45.95 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  41.67 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  41.18 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3688  SirA-like  42.86 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1644  SirA family protein  51.47 
 
 		 100 aa  60.1  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  40.58 
 
 		 84 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  42.86 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  39.13 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  33.78 
 
 		 75 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2018  SirA protein, putative  39.71 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0674453  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  35.53 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  44.44 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  39.44 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  41.18 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  41.18 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  40 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  39.73 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  39.44 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  41.18 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  39.13 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  40.3 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  42.65 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  41.18 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  42.65 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  42.65 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  42.65 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  41.18 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4174  SirA family protein  42.25 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  41.18 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  45.07 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  39.13 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  38.96 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  41.18 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  41.18 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  35.53 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  38.24 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  39.71 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  39.71 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  42.65 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  38.03 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  43.48 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  38.24 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>