33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2198 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2198  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  305  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  53.25 
 
 		 155 aa  151  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  53.14 
 
 		 178 aa  144  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  45.78 
 
 		 175 aa  141  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  49.7 
 
 		 181 aa  140  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  43.9 
 
 		 177 aa  140  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  46.2 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  42.24 
 
 		 174 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  50.34 
 
 		 151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  50.62 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  50.64 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  49.29 
 
 		 144 aa  128  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  44.44 
 
 		 182 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  45.62 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  50.64 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  42.39 
 
 		 206 aa  117  9e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  40.69 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  40.69 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  37.91 
 
 		 181 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  42.42 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  33.8 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0106  hypothetical protein  34.97 
 
 		 190 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1294  hypothetical protein  41.56 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  34.51 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000000085919  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  30.86 
 
 		 189 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1741  MOSC domain-containing protein  35.9 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0016  hypothetical protein  26.71 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226962 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0010  hypothetical protein  30.25 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  28.33 
 
 		 174 aa  41.6  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4294  hypothetical protein  30.95 
 
 		 197 aa  41.2  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17157  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  24.65 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  31.65 
 
 		 156 aa  40.8  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3520  hypothetical protein  27.41 
 
 		 229 aa  40.4  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344482  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>