101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2174 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  100 
 
 		 405 aa  812    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  72.18 
 
 		 393 aa  566  1e-160  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  68.53 
 
 		 398 aa  560  1e-158  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  67.45 
 
 		 387 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  65.36 
 
 		 398 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  65.36 
 
 		 387 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  59.47 
 
 		 388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  47 
 
 		 421 aa  327  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  46.48 
 
 		 421 aa  326  5e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  47.71 
 
 		 417 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  44.24 
 
 		 435 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  46.96 
 
 		 403 aa  317  3e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  44.78 
 
 		 417 aa  315  6e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  43.93 
 
 		 420 aa  313  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  46.21 
 
 		 421 aa  309  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  45.69 
 
 		 416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  45.58 
 
 		 428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  45.24 
 
 		 430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  44.66 
 
 		 431 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  43.8 
 
 		 408 aa  293  5e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  44.51 
 
 		 417 aa  292  6e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  43.29 
 
 		 471 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  43.01 
 
 		 418 aa  282  9e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  47.49 
 
 		 380 aa  281  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  44.44 
 
 		 424 aa  278  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  40.91 
 
 		 380 aa  266  5e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  41.99 
 
 		 407 aa  262  8e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  39.89 
 
 		 406 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  41.58 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  41.14 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  37.86 
 
 		 401 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  37.86 
 
 		 401 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  37.86 
 
 		 401 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  38.44 
 
 		 419 aa  236  6e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  37.05 
 
 		 379 aa  224  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  36.45 
 
 		 379 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  36.7 
 
 		 441 aa  219  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  36.62 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  34.57 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  36.09 
 
 		 416 aa  204  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  32.49 
 
 		 383 aa  203  6e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  31.23 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  36.25 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  36.74 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  35.92 
 
 		 384 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  30.67 
 
 		 369 aa  181  1e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  34.89 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  34.89 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  33.06 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  33.91 
 
 		 424 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  31.55 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  33.71 
 
 		 386 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  34.2 
 
 		 385 aa  163  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  33.05 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  33.14 
 
 		 385 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  33.06 
 
 		 399 aa  156  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  33.68 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  29.63 
 
 		 397 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  29.32 
 
 		 397 aa  143  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  33.85 
 
 		 385 aa  142  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  33.85 
 
 		 385 aa  142  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  32.45 
 
 		 411 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  29.15 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  29.27 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  30.87 
 
 		 392 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  27.27 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  30.36 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  24.33 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  28.99 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  25.26 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  28.86 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  26.45 
 
 		 427 aa  99.4  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  26.45 
 
 		 427 aa  99.4  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  26.45 
 
 		 427 aa  99.4  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  27.45 
 
 		 562 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  27.91 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  27.65 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1114  HK97 family phage major capsid protein  24.81 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  24.51 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  26.42 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  28.25 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  25.84 
 
 		 425 aa  66.2  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  22.63 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  26.29 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  22.96 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  27.23 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  25.83 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2995  phage major capsid protein, gp36  25.28 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2474  major capsid protein HK97  23.66 
 
 		 483 aa  53.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1645  putative phage-related protein  26.06 
 
 		 444 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  24.04 
 
 		 514 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2852  phage major capsid protein, HK97 family  23.15 
 
 		 466 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  normal  0.025439 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3666  major capsid protein HK97  23.43 
 
 		 337 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.017941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0468  prophage LambdaBa04, major capsid protein  26.74 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  24.44 
 
 		 279 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0446  prophage LambdaBa04, major capsid protein  26.74 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1719  HK97 family phage major capsid protein  21.32 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0627  phage major capsid protein, HK97 family  23.7 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  23.85 
 
 		 437 aa  44.3  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  23.77 
 
 		 438 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>