More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2132 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  83.47 
 
 		 486 aa  843    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2454  amidophosphoribosyltransferase  84.08 
 
 		 487 aa  853    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  81.53 
 
 		 497 aa  829    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2132  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 		 508 aa  1043    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.864953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  81.19 
 
 		 499 aa  810    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1117  amidophosphoribosyltransferase  84.08 
 
 		 487 aa  854    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.981489  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  57.86 
 
 		 502 aa  578  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  59.34 
 
 		 493 aa  578  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  57.58 
 
 		 488 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  60.6 
 
 		 490 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  59.38 
 
 		 486 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  56.58 
 
 		 517 aa  568  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1763  amidophosphoribosyltransferase  57.92 
 
 		 496 aa  559  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.644721  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  57.2 
 
 		 501 aa  559  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  57.2 
 
 		 514 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  57.97 
 
 		 514 aa  554  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  59.02 
 
 		 503 aa  554  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  59.57 
 
 		 499 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  55.85 
 
 		 509 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  57.23 
 
 		 491 aa  545  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  57.23 
 
 		 491 aa  545  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  58.49 
 
 		 491 aa  548  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  59.14 
 
 		 500 aa  547  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  57.65 
 
 		 491 aa  548  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2282  amidophosphoribosyltransferase  55.95 
 
 		 503 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.235461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0413  amidophosphoribosyltransferase  57.95 
 
 		 491 aa  542  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.577853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2452  amidophosphoribosyltransferase  58.25 
 
 		 514 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  57.26 
 
 		 500 aa  531  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3787  amidophosphoribosyltransferase  57.97 
 
 		 510 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0727  amidophosphoribosyltransferase  55.58 
 
 		 496 aa  522  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0560  amidophosphoribosyltransferase  55.7 
 
 		 496 aa  521  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.605887  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1042  amidophosphoribosyltransferase  55.79 
 
 		 496 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1187  amidophosphoribosyltransferase  55.36 
 
 		 496 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  55.05 
 
 		 476 aa  518  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2017  amidophosphoribosyltransferase  56.64 
 
 		 504 aa  513  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1499  amidophosphoribosyltransferase  55.48 
 
 		 529 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338535  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2293  amidophosphoribosyltransferase  54.02 
 
 		 504 aa  514  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  52.67 
 
 		 475 aa  513  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0486  amidophosphoribosyltransferase  53.62 
 
 		 496 aa  509  1e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.937235  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  52.18 
 
 		 474 aa  504  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0453  amidophosphoribosyltransferase  55.23 
 
 		 509 aa  499  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0446  amidophosphoribosyltransferase  56.22 
 
 		 485 aa  501  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  52.17 
 
 		 468 aa  496  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  51.86 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  52.03 
 
 		 467 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  51.51 
 
 		 477 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  51.08 
 
 		 477 aa  489  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1205  amidophosphoribosyltransferase  51.35 
 
 		 493 aa  486  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 		 474 aa  488  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  50.98 
 
 		 451 aa  476  1e-133  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  51.62 
 
 		 481 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  51.62 
 
 		 475 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  50.83 
 
 		 485 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  50.83 
 
 		 485 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  51.45 
 
 		 485 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  50.42 
 
 		 482 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_002978  WD1109  amidophosphoribosyltransferase  50.64 
 
 		 461 aa  465  1e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  51.96 
 
 		 484 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0139  amidophosphoribosyltransferase  47.21 
 
 		 462 aa  459  9.999999999999999e-129  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  47.71 
 
 		 461 aa  443  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5556  amidophosphoribosyltransferase  51.52 
 
 		 511 aa  443  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  47.97 
 
 		 503 aa  441  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0090  amidophosphoribosyltransferase  48.37 
 
 		 462 aa  441  9.999999999999999e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  49.05 
 
 		 500 aa  436  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  47.13 
 
 		 495 aa  437  1e-121  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0194  amidophosphoribosyltransferase  47.97 
 
 		 463 aa  438  1e-121  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0142686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  49.35 
 
 		 480 aa  438  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  47.08 
 
 		 471 aa  437  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  45.77 
 
 		 465 aa  435  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  46.65 
 
 		 472 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  47.26 
 
 		 496 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  46.44 
 
 		 471 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  46.22 
 
 		 471 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  46.44 
 
 		 471 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  46.44 
 
 		 471 aa  431  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  46.44 
 
 		 471 aa  431  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  46.44 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  46.44 
 
 		 471 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  46.67 
 
 		 473 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  46.67 
 
 		 473 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  46.44 
 
 		 471 aa  429  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  49.36 
 
 		 466 aa  429  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  49.02 
 
 		 472 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  46.44 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  47.36 
 
 		 480 aa  425  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  44.28 
 
 		 475 aa  426  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  48.59 
 
 		 472 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  48.28 
 
 		 502 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  46.96 
 
 		 470 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  46.22 
 
 		 471 aa  428  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0026  amidophosphoribosyltransferase  44.78 
 
 		 484 aa  423  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  45.97 
 
 		 470 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  45.61 
 
 		 463 aa  424  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  48.43 
 
 		 488 aa  424  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  46.81 
 
 		 462 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  48.04 
 
 		 472 aa  420  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  45.04 
 
 		 474 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  46.32 
 
 		 493 aa  419  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  46.41 
 
 		 506 aa  421  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  47.5 
 
 		 506 aa  420  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>