48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2075 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2075  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  288  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0376  protein of unknown function DUF302  49.61 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1764  protein of unknown function DUF302  45.74 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0949  hypothetical protein  45.61 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.811465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1896  hypothetical protein  46.15 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001057  putative inner membrane or exported protein  41.67 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2794  hypothetical protein  48.67 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.4262  normal  0.709682 
 
 
-
 
NC_004310  BR1369  crcB family protein  40.29 
 
 		 254 aa  106  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1325  camphor resistance protein CrcB  40.29 
 
 		 270 aa  106  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2096  hypothetical protein  38.19 
 
 		 150 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3395  hypothetical protein  44.19 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1941  hypothetical protein  36.36 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0512  hypothetical protein  34.97 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.915743  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2735  hypothetical protein  42.2 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1673  hypothetical protein  35.61 
 
 		 172 aa  104  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00536019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4835  hypothetical protein  37.68 
 
 		 197 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1823  hypothetical protein  43.31 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3845  protein of unknown function DUF302  49.52 
 
 		 133 aa  96.7  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0744952 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2556  hypothetical protein  40.85 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05960  hypothetical protein  34.07 
 
 		 306 aa  95.5  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0678707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1260  hypothetical protein  44.8 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8087  protein of unknown function DUF302  36.59 
 
 		 163 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1272  hypothetical protein  38.84 
 
 		 121 aa  87.4  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6375  protein of unknown function DUF302  43.24 
 
 		 165 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2874  hypothetical protein  36.57 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4759  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal  0.706872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4906  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0532643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4859  hypothetical protein  40.48 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.103571 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4909  domain of unknown function superfamily  40.34 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4835  hypothetical protein  40.48 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.770482  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2704  hypothetical protein  41.44 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556991  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8650  protein of unknown function DUF302  39.84 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1559  protein of unknown function DUF302  38.32 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874349  normal  0.0163758 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0543  protein of unknown function DUF302  38.66 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1779  hypothetical protein  35.42 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5867  hypothetical protein  39.45 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244323  normal  0.372797 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0349  periplasmic protein  32.03 
 
 		 168 aa  72  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.112084  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5442  hypothetical protein  42.31 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1380  protein of unknown function DUF302  39.42 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0007  protein of unknown function DUF302  40 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.120765 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1665  hypothetical protein  35 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1972  protein of unknown function DUF302  31.3 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3562  hypothetical protein  37.93 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3413  hypothetical protein  44.83 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1248  protein of unknown function DUF302  26.83 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0155671  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3932  hypothetical protein  30.3 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0971  protein of unknown function DUF302  31.25 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.294774 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2156  hypothetical protein  31.18 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.612651  normal  0.115283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>