196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2065 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  100 
 
 
201 aa  416  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  73.63 
 
 
201 aa  319  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  72.14 
 
 
201 aa  310  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  66.33 
 
 
194 aa  270  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  64.18 
 
 
194 aa  265  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  63.68 
 
 
194 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  63.32 
 
 
220 aa  259  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  48.78 
 
 
201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  49.27 
 
 
202 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  46.08 
 
 
203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  49.03 
 
 
202 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  44.93 
 
 
207 aa  182  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  46.08 
 
 
203 aa  181  9.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  46.08 
 
 
203 aa  180  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  48.04 
 
 
203 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  47.55 
 
 
216 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  44.17 
 
 
205 aa  175  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  49.51 
 
 
209 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  44.39 
 
 
205 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.6 
 
 
209 aa  174  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  48.66 
 
 
209 aa  173  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  42.03 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  42.93 
 
 
201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  43.9 
 
 
205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  43.14 
 
 
201 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  43.9 
 
 
201 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  40.58 
 
 
230 aa  170  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  40.58 
 
 
230 aa  170  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  45.85 
 
 
200 aa  169  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  42.93 
 
 
205 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  47.8 
 
 
203 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  49.02 
 
 
202 aa  169  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  42.72 
 
 
208 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  43.9 
 
 
212 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  42.65 
 
 
201 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  41.06 
 
 
229 aa  168  5e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.8 
 
 
203 aa  168  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  42.51 
 
 
207 aa  168  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  45.19 
 
 
206 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  43.75 
 
 
208 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  44.61 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  43.96 
 
 
208 aa  165  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  44.44 
 
 
206 aa  165  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  42.31 
 
 
208 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  44.23 
 
 
221 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  43.69 
 
 
209 aa  164  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  43.69 
 
 
230 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  44.88 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  41.83 
 
 
208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  44.02 
 
 
210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  44.39 
 
 
205 aa  160  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  42.79 
 
 
209 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  45.7 
 
 
210 aa  159  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  45.7 
 
 
206 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  44.02 
 
 
212 aa  158  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  43.54 
 
 
208 aa  158  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.06 
 
 
209 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  41.46 
 
 
207 aa  157  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  43.54 
 
 
209 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  43.06 
 
 
209 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  43.06 
 
 
209 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  43.06 
 
 
209 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  42.78 
 
 
209 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  41.46 
 
 
207 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  43.06 
 
 
208 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  43.06 
 
 
209 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  43.06 
 
 
208 aa  155  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  40.49 
 
 
218 aa  154  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  42.93 
 
 
218 aa  153  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  38.65 
 
 
241 aa  153  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  43.55 
 
 
207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  42.44 
 
 
209 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  42.79 
 
 
201 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.03 
 
 
201 aa  148  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  42.03 
 
 
201 aa  148  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  44.06 
 
 
209 aa  147  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  38.83 
 
 
218 aa  147  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.926616 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  39 
 
 
211 aa  147  9e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  44.55 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  41.21 
 
 
184 aa  145  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  45.3 
 
 
203 aa  143  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  42.23 
 
 
221 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.29 
 
 
209 aa  141  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  44.2 
 
 
203 aa  139  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.88 
 
 
206 aa  137  8.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  50.75 
 
 
140 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.89 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.86 
 
 
219 aa  127  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  36.76 
 
 
201 aa  125  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  38.71 
 
 
207 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.29 
 
 
197 aa  122  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  36.46 
 
 
200 aa  121  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0945  hypothetical protein  38.67 
 
 
210 aa  118  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  34.24 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.18 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  33.15 
 
 
209 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.43 
 
 
216 aa  109  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  35.54 
 
 
221 aa  109  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  36.46 
 
 
228 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  33.89 
 
 
203 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939622 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>