83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1953 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  100 
 
 		 308 aa  632  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.09 
 
 		 353 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  36.4 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  28.68 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  31.73 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  33.47 
 
 		 336 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  30.46 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.3 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  32.08 
 
 		 357 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  26.69 
 
 		 325 aa  112  8.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.19 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  28.44 
 
 		 322 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  30.37 
 
 		 361 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  26.78 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  27.56 
 
 		 335 aa  99.8  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  29.89 
 
 		 451 aa  95.5  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  28.68 
 
 		 471 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.97 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  26.64 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  25.71 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  26.57 
 
 		 795 aa  85.9  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  27.62 
 
 		 464 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.27 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  36.21 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  24.68 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  32.62 
 
 		 392 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  25.58 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  27.32 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  29.24 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  27.88 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  27.23 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  27.04 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  26.79 
 
 		 659 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  26.01 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  25.5 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  30.06 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.3 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  34.12 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  23.94 
 
 		 544 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  33.58 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  28.92 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  20.8 
 
 		 486 aa  62.4  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  28.93 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.75 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  24.9 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  25 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  23.6 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3488  hypothetical protein  20.19 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.76 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  24.79 
 
 		 1002 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.73 
 
 		 286 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  26.49 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  25.74 
 
 		 447 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  26.09 
 
 		 461 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  30.81 
 
 		 442 aa  52.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  27.27 
 
 		 422 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  27.21 
 
 		 656 aa  49.3  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  23.43 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  23.4 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6756  phospholipase/carboxylesterase  27.57 
 
 		 225 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  32.58 
 
 		 432 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  28.15 
 
 		 378 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  24.86 
 
 		 363 aa  47  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  28.12 
 
 		 414 aa  46.6  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  27.11 
 
 		 270 aa  46.6  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3289  PHB depolymerase family esterase  22.47 
 
 		 683 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  24.6 
 
 		 269 aa  46.6  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0658  PHB depolymerase family esterase  22.47 
 
 		 683 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.726264 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  25.17 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  24.38 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  23 
 
 		 365 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  23 
 
 		 365 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  23.43 
 
 		 359 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  25.09 
 
 		 372 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  23 
 
 		 365 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  25.91 
 
 		 410 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  22.26 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  24.53 
 
 		 355 aa  43.5  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  23.43 
 
 		 334 aa  43.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  24.05 
 
 		 398 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  25.41 
 
 		 279 aa  42.7  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  25.66 
 
 		 374 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3819  PHB depolymerase family esterase  27.34 
 
 		 419 aa  42.4  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>