296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1860 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  100 
 
 		 105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  75 
 
 		 94 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  63.55 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  70.09 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  70.09 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  59.05 
 
 		 143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  70.45 
 
 		 109 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  70 
 
 		 93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  57.94 
 
 		 133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  57.55 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  56.07 
 
 		 144 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  52.78 
 
 		 113 aa  122  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  55.14 
 
 		 110 aa  120  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  52.78 
 
 		 113 aa  120  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  51.85 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  62.07 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  52.38 
 
 		 111 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  49.5 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  54.81 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  54.81 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  56.07 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  52.29 
 
 		 115 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  55.14 
 
 		 142 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  56.48 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  58.33 
 
 		 114 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  57.89 
 
 		 104 aa  105  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 107 aa  103  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  59.04 
 
 		 115 aa  103  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  46.94 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  51.14 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  55.95 
 
 		 111 aa  100  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  54.12 
 
 		 110 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  46.08 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  46.08 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  49.51 
 
 		 108 aa  98.6  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  48.94 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  50.51 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  52.75 
 
 		 154 aa  97.1  8e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  56.1 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  48.04 
 
 		 111 aa  95.9  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  44.33 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  54.32 
 
 		 110 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  50.59 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  45.45 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  50.59 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  50.59 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  50.59 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  50.59 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  50.59 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  48.54 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  50.59 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  50.59 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  55.56 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2659  preprotein tranlocase protein  50.54 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32408  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  52.27 
 
 		 113 aa  94  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  54.32 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1797  protein translocase subunit yajC  48.11 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422373  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  43.75 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  47.19 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  46.07 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  46.07 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  53.49 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  46 
 
 		 123 aa  92  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  49.41 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  53.66 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  44.71 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  49.51 
 
 		 108 aa  90.5  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  45.83 
 
 		 112 aa  90.5  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1693  preprotein translocase, YajC subunit  51.38 
 
 		 115 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  47.62 
 
 		 106 aa  90.1  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  47.47 
 
 		 103 aa  88.6  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  49.49 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  45.65 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  49.49 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  51.19 
 
 		 107 aa  88.6  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  51.92 
 
 		 112 aa  87.8  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  45.05 
 
 		 102 aa  87.8  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  51.22 
 
 		 178 aa  88.2  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  41.35 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  41.35 
 
 		 110 aa  87.4  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  52.44 
 
 		 113 aa  87  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  50.67 
 
 		 106 aa  86.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  46.43 
 
 		 93 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  46.51 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  55 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  43.53 
 
 		 92 aa  85.9  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  53.42 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  44.09 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  48.94 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  41.35 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  46.51 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  45.24 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>