217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1813 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  100 
 
 		 429 aa  835    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  52.11 
 
 		 429 aa  437  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  54.76 
 
 		 424 aa  430  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  53.68 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  53.68 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  53.92 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  51.54 
 
 		 421 aa  421  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  53.56 
 
 		 416 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  46.96 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 428 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  35.9 
 
 		 397 aa  249  9e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 443 aa  239  9e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 412 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 427 aa  219  7.999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  35.51 
 
 		 410 aa  216  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 429 aa  216  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 409 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  33.48 
 
 		 436 aa  209  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 411 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  34.97 
 
 		 411 aa  206  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 447 aa  203  5e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  34.64 
 
 		 433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 		 432 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 408 aa  196  8.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 446 aa  195  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 417 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  30.45 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 		 430 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  30.84 
 
 		 412 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  29.54 
 
 		 412 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  31.33 
 
 		 418 aa  183  6e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  31.33 
 
 		 418 aa  182  7e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 471 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  30.36 
 
 		 412 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 713 aa  179  9e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  30.85 
 
 		 427 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 433 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  30.61 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  30.75 
 
 		 443 aa  176  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 425 aa  176  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  31.84 
 
 		 427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 415 aa  172  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  28.04 
 
 		 726 aa  170  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  30.65 
 
 		 404 aa  167  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 420 aa  160  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 431 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0101  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 430 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 481 aa  150  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  29.89 
 
 		 412 aa  149  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  30.42 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  29.05 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  30.42 
 
 		 395 aa  145  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  27.7 
 
 		 520 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  29.18 
 
 		 438 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 		 454 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  28.46 
 
 		 398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  27.13 
 
 		 444 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 464 aa  141  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 446 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  29.71 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 476 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 443 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  26.39 
 
 		 474 aa  137  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  27.33 
 
 		 434 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 476 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  27.29 
 
 		 434 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 480 aa  136  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 480 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 474 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 480 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 480 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 447 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 473 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 459 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  28.53 
 
 		 412 aa  132  9e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  26.05 
 
 		 465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  27.45 
 
 		 414 aa  130  6e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0691  hypothetical protein  27.38 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.256683  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0467  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 439 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.677382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 474 aa  124  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3470  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 421 aa  121  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  27.89 
 
 		 385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3325  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 380 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  27.34 
 
 		 380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1179  transmembrane transport protein  23.1 
 
 		 407 aa  110  7.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>