More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1654 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  100 
 
 		 435 aa  888    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  0.0000345699 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  68.11 
 
 		 444 aa  624  1e-177  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  69.84 
 
 		 433 aa  604  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  64.77 
 
 		 440 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  64.77 
 
 		 440 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1146  Beta-glucosidase  64.55 
 
 		 440 aa  570  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  48.03 
 
 		 443 aa  364  2e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  43.36 
 
 		 446 aa  363  2e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  43.36 
 
 		 446 aa  363  3e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  42.89 
 
 		 446 aa  360  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  44.39 
 
 		 453 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  45.82 
 
 		 448 aa  354  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  44.27 
 
 		 478 aa  353  4e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  46.79 
 
 		 489 aa  349  5e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  40.47 
 
 		 446 aa  349  6e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  45.15 
 
 		 457 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  40.99 
 
 		 438 aa  347  2e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  41.04 
 
 		 471 aa  346  4e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  44.3 
 
 		 457 aa  345  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  42.31 
 
 		 439 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  42.82 
 
 		 450 aa  344  1e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  43.3 
 
 		 474 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  41.71 
 
 		 451 aa  345  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  43.21 
 
 		 470 aa  343  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  43.59 
 
 		 444 aa  339  7e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  44.06 
 
 		 443 aa  338  9e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  45.72 
 
 		 468 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  44.06 
 
 		 458 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  44.59 
 
 		 467 aa  336  5e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  44.35 
 
 		 467 aa  334  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  43.34 
 
 		 463 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  44.64 
 
 		 472 aa  333  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  46.74 
 
 		 482 aa  330  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  41.67 
 
 		 476 aa  331  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  44.49 
 
 		 478 aa  331  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  42.18 
 
 		 474 aa  330  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  44 
 
 		 462 aa  330  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  43.19 
 
 		 440 aa  328  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  42.92 
 
 		 443 aa  328  8e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  41.47 
 
 		 456 aa  328  9e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  45.17 
 
 		 457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  43.74 
 
 		 465 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  42.95 
 
 		 484 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  42.23 
 
 		 446 aa  326  5e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  43.61 
 
 		 458 aa  326  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  45.07 
 
 		 460 aa  326  6e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  41.72 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  42.26 
 
 		 451 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  42.76 
 
 		 472 aa  325  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  42.03 
 
 		 451 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  42.47 
 
 		 467 aa  323  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  43.45 
 
 		 488 aa  323  3e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  42.26 
 
 		 451 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  43.72 
 
 		 448 aa  323  3e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  44.07 
 
 		 455 aa  323  5e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  42.82 
 
 		 451 aa  322  8e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  45.29 
 
 		 453 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  45.57 
 
 		 494 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  41.8 
 
 		 449 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  42.44 
 
 		 478 aa  318  9e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  41.89 
 
 		 463 aa  318  9e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  44.92 
 
 		 472 aa  317  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  44.3 
 
 		 517 aa  316  5e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  44.26 
 
 		 436 aa  316  5e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  43.14 
 
 		 466 aa  315  7e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  37.5 
 
 		 452 aa  315  9e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  43.05 
 
 		 445 aa  315  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  41.51 
 
 		 494 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  43.17 
 
 		 500 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  41 
 
 		 448 aa  312  5.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  41.12 
 
 		 439 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  43.89 
 
 		 468 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  44.76 
 
 		 437 aa  310  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  40.68 
 
 		 452 aa  309  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  42.42 
 
 		 452 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  41.65 
 
 		 450 aa  309  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  43.38 
 
 		 488 aa  308  8e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  41.08 
 
 		 444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  39.77 
 
 		 470 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  40.45 
 
 		 456 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  42.17 
 
 		 459 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  41.67 
 
 		 455 aa  305  9.000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  41.86 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  44.65 
 
 		 447 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  44.32 
 
 		 463 aa  301  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  39.04 
 
 		 453 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  41.69 
 
 		 466 aa  299  7e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  39.91 
 
 		 447 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  41.08 
 
 		 479 aa  297  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4086  beta-galactosidase  40.84 
 
 		 486 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  40.31 
 
 		 482 aa  296  6e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  42.26 
 
 		 470 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  43.35 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  41.52 
 
 		 463 aa  293  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  40.58 
 
 		 457 aa  293  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  40.52 
 
 		 485 aa  290  4e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  37.99 
 
 		 450 aa  288  9e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  39.86 
 
 		 452 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  35.93 
 
 		 450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  38.27 
 
 		 447 aa  286  5.999999999999999e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>