More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1642 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 876 aa  939    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 876 aa  939    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 874 aa  848    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 875 aa  797    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 874 aa  853    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  50.28 
 
 		 872 aa  814    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 874 aa  850    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 867 aa  819    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0862  alanyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 877 aa  868    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.74806  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  49.72 
 
 		 884 aa  831    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 874 aa  880    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1042  alanyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 876 aa  835    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0613  alanyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 842 aa  711    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1201  alanyl-tRNA synthetase  67.55 
 
 		 885 aa  1157    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 		 874 aa  875    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  51.86 
 
 		 874 aa  872    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 886 aa  643    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 874 aa  850    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2323  alanyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 		 875 aa  816    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0626442  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 874 aa  847    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 860 aa  826    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 860 aa  826    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 		 899 aa  851    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1460  alanyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 890 aa  819    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.124208  hitchhiker  0.00581407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3303  alanyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 		 871 aa  852    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.243985 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0728  alanyl-tRNA synthetase  61.21 
 
 		 886 aa  1102    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.846267  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 874 aa  870    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0146  alanyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 891 aa  725    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00216765  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0553  alanyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 		 886 aa  833    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1287  alanyl-tRNA synthetase  62.98 
 
 		 891 aa  1074    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.178643 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 		 863 aa  843    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 874 aa  850    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  50.51 
 
 		 873 aa  848    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4275  alanyl-tRNA synthetase  52.32 
 
 		 874 aa  843    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0551773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0451  alanyl-tRNA synthetase  76.01 
 
 		 883 aa  1310    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 882 aa  807    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 		 897 aa  857    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 		 874 aa  845    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 879 aa  812    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 876 aa  798    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 880 aa  791    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  50.06 
 
 		 864 aa  850    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2104  alanyl-tRNA synthetase  75.65 
 
 		 883 aa  1305    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653271  normal  0.762887 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1898  alanyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 851 aa  701    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.352865  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 886 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 880 aa  670    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0022  alanyl-tRNA synthetase  51.45 
 
 		 862 aa  819    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2818  alanyl-tRNA synthetase  61.17 
 
 		 883 aa  1026    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 881 aa  735    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 874 aa  819    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 905 aa  751    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3737  alanyl-tRNA synthetase  62.44 
 
 		 891 aa  1077    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0179762  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1279  alanyl-tRNA synthetase  65.56 
 
 		 881 aa  1100    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302491  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0156  alanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 848 aa  683    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0981  alanyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 887 aa  717    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1987  alanyl-tRNA synthetase  74.75 
 
 		 884 aa  1290    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0590  alanyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 876 aa  833    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 		 875 aa  858    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1571  alanyl-tRNA synthetase  64.42 
 
 		 890 aa  1100    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.673823  decreased coverage  0.000202808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 874 aa  857    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2910  alanyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 878 aa  806    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.70978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 874 aa  860    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  51.86 
 
 		 874 aa  880    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1734  alanyl-tRNA synthetase  63.23 
 
 		 891 aa  1082    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 868 aa  834    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1621  alanyl-tRNA synthetase  63.16 
 
 		 897 aa  1079    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 890 aa  833    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 884 aa  870    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0205  alanyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 		 884 aa  764    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2628  alanyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 		 874 aa  818    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1232  alanyl-tRNA synthetase  71.14 
 
 		 902 aa  1255    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1720  alanyl-tRNA synthetase  62.87 
 
 		 884 aa  1024    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 		 897 aa  859    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 		 865 aa  915    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1266  alanyl-tRNA synthetase  64.22 
 
 		 909 aa  1069    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1446  alanyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 877 aa  637    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.714674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 879 aa  659    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 879 aa  660    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 		 874 aa  877    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 874 aa  850    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 874 aa  876    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 874 aa  875    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  49.94 
 
 		 869 aa  816    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 		 874 aa  860    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 880 aa  703    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1008  alanyl-tRNA synthetase  59.51 
 
 		 884 aa  1004    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 		 874 aa  859    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 		 874 aa  878    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3035  alanyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 		 948 aa  746    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12081  normal  0.0855444 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 897 aa  861    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 885 aa  748    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  54.31 
 
 		 878 aa  896    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 874 aa  878    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1029  alanyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 845 aa  736    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00361534  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 878 aa  795    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0534  alanyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 842 aa  713    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0598  alanyl-tRNA synthetase  73.14 
 
 		 885 aa  1318    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 900 aa  879    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3380  alanyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 		 867 aa  827    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.030284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 876 aa  818    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>