173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1619 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  100 
 
 		 536 aa  1103    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  53.94 
 
 		 546 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.94 
 
 		 546 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.31 
 
 		 540 aa  552  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.16 
 
 		 544 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.45 
 
 		 531 aa  533  1e-150  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.72 
 
 		 535 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.770213 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.21 
 
 		 559 aa  278  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  31.46 
 
 		 563 aa  265  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.96 
 
 		 560 aa  265  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.22 
 
 		 560 aa  265  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.27 
 
 		 563 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  32.87 
 
 		 563 aa  258  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.54 
 
 		 560 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.01 
 
 		 565 aa  254  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.13 
 
 		 566 aa  254  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.93 
 
 		 560 aa  251  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.53 
 
 		 556 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  37.27 
 
 		 598 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.97 
 
 		 560 aa  244  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.89 
 
 		 549 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.74 
 
 		 549 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1223  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.6 
 
 		 775 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213789  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  30.52 
 
 		 571 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0991  hypothetical protein  33.13 
 
 		 811 aa  233  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.95434 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.28 
 
 		 716 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.52 
 
 		 724 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257633  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.09 
 
 		 629 aa  231  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.12 
 
 		 547 aa  230  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1428  hypothetical protein  33.4 
 
 		 718 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3977  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 730 aa  226  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 672 aa  225  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3150  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.1 
 
 		 654 aa  225  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2979  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.14 
 
 		 648 aa  224  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.32051  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  31.48 
 
 		 546 aa  224  4e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.08 
 
 		 549 aa  224  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.27 
 
 		 670 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6864  hypothetical protein  32.74 
 
 		 702 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.337654  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.46 
 
 		 599 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0141  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.67 
 
 		 624 aa  219  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.764176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2752  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.54 
 
 		 646 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  29.77 
 
 		 661 aa  219  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4967  hypothetical protein  33.41 
 
 		 523 aa  219  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2875  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.74 
 
 		 662 aa  217  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.929395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  33.4 
 
 		 540 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  33.06 
 
 		 557 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.86 
 
 		 525 aa  213  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  33.07 
 
 		 554 aa  211  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2235  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.32 
 
 		 637 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328672 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  31.08 
 
 		 607 aa  209  8e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.97 
 
 		 625 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2015  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.29 
 
 		 636 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  29.07 
 
 		 568 aa  207  5e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  33.66 
 
 		 615 aa  206  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  33.66 
 
 		 615 aa  206  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  33.66 
 
 		 615 aa  206  8e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  31.15 
 
 		 615 aa  206  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  33.66 
 
 		 615 aa  206  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.66 
 
 		 615 aa  206  9e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  29.39 
 
 		 558 aa  205  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  33.66 
 
 		 611 aa  205  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1575  hypothetical protein  33.73 
 
 		 631 aa  204  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00305451  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  33.17 
 
 		 615 aa  204  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0041  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.66 
 
 		 506 aa  204  4e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0945132  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1861  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.45 
 
 		 539 aa  203  7e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  35.11 
 
 		 419 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.85 
 
 		 668 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  33.82 
 
 		 615 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  33.09 
 
 		 616 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2078  hypothetical protein  30.9 
 
 		 614 aa  200  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142171  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  33.67 
 
 		 606 aa  200  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.07 
 
 		 540 aa  199  9e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  30.68 
 
 		 537 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  32.92 
 
 		 615 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  32.8 
 
 		 656 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  32.92 
 
 		 615 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  32.92 
 
 		 615 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.32 
 
 		 516 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1898  peptidoglycan binding domain-containing protein  32 
 
 		 521 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.1 
 
 		 443 aa  197  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  32.08 
 
 		 564 aa  196  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  30.93 
 
 		 530 aa  196  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0887  hypothetical protein  33.18 
 
 		 524 aa  196  9e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2805  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.4 
 
 		 674 aa  196  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2395  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.54 
 
 		 525 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315438  normal  0.0441683 
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  32.72 
 
 		 572 aa  195  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  31.16 
 
 		 563 aa  195  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0148  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.26 
 
 		 533 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246711  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.93 
 
 		 521 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1899  hypothetical protein  28.18 
 
 		 561 aa  190  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.131383  hitchhiker  0.000892254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3935  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.4 
 
 		 534 aa  190  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444109  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02710  hypothetical protein  36.58 
 
 		 530 aa  190  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2592  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.03 
 
 		 543 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000115115  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01179  putative periplasmic protein  34.44 
 
 		 410 aa  189  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383601  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.56 
 
 		 500 aa  189  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.01 
 
 		 458 aa  189  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1924  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.67 
 
 		 521 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0712521  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003127  L,D-transpeptidase YcbB  36.98 
 
 		 513 aa  188  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00544147  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.79 
 
 		 533 aa  189  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.61 
 
 		 433 aa  187  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>