More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1605 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 202 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  60.42 
 
 		 191 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  68.83 
 
 		 189 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  58.33 
 
 		 204 aa  215  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  58.33 
 
 		 204 aa  214  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  54.77 
 
 		 204 aa  214  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  61.24 
 
 		 215 aa  207  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  63.16 
 
 		 280 aa  154  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  55.86 
 
 		 280 aa  132  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  54.7 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  58.04 
 
 		 362 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  47.52 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  59.63 
 
 		 206 aa  128  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  55.36 
 
 		 362 aa  126  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  47.86 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  58.93 
 
 		 354 aa  124  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  52.5 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  33.66 
 
 		 261 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  55.08 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  50.89 
 
 		 228 aa  122  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  44.12 
 
 		 261 aa  122  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  49.15 
 
 		 325 aa  122  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  45.74 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  45.74 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  51.72 
 
 		 318 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  52.14 
 
 		 217 aa  121  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  47.9 
 
 		 368 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  43.7 
 
 		 261 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  45.74 
 
 		 261 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3565  Lytic transglycosylase catalytic  56.64 
 
 		 158 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  43.7 
 
 		 238 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  52.54 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  56.25 
 
 		 199 aa  118  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  52.54 
 
 		 197 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  44.96 
 
 		 261 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  42.65 
 
 		 261 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  44.96 
 
 		 261 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  44.96 
 
 		 261 aa  117  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  49.15 
 
 		 438 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  52.54 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  50.43 
 
 		 242 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  50.91 
 
 		 283 aa  115  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3638  lytic transglycosylase catalytic  57.29 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.237 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  49.54 
 
 		 235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  54.55 
 
 		 207 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  53.57 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  39.26 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  47.5 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  49.63 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4561  lytic transglycosylase catalytic  40.91 
 
 		 360 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000593543  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  44.63 
 
 		 174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  51.28 
 
 		 244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  55.36 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0527  Lytic transglycosylase catalytic  52.73 
 
 		 155 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.193488 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  49.57 
 
 		 202 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3973  lytic transglycosylase catalytic  55.21 
 
 		 204 aa  111  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  41.78 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3822  lytic transglycosylase, catalytic  50.91 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.539253  normal  0.0346403 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  49.11 
 
 		 146 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  50.93 
 
 		 263 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  53.64 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  50.85 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  47.27 
 
 		 370 aa  108  6e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0512  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 154 aa  108  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.318275 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  46.92 
 
 		 204 aa  107  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  34.52 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  55.79 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  50.89 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  44.52 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  49.6 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  52.83 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  45.87 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  50.91 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  47.5 
 
 		 299 aa  105  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  46.09 
 
 		 442 aa  105  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5361  lytic transglycosylase, catalytic  52.54 
 
 		 333 aa  104  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.716209 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  49.07 
 
 		 234 aa  104  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  35.1 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  47.27 
 
 		 273 aa  103  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  48.74 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  48.18 
 
 		 305 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  41.41 
 
 		 247 aa  103  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  46.67 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  41.6 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  52.25 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  47.71 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  49.17 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  54.21 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  44.96 
 
 		 297 aa  102  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  34.13 
 
 		 204 aa  101  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  49.15 
 
 		 209 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  48.74 
 
 		 239 aa  101  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  47.22 
 
 		 327 aa  101  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  44.96 
 
 		 297 aa  101  8e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  45 
 
 		 217 aa  99.4  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0443  lytic transglycosylase, catalytic  49.21 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  42.75 
 
 		 245 aa  99  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>