More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1566 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1566  GTP-binding protein  100 
 
 		 415 aa  816    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  0.0486132 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1355  GTP-binding protein, HSR1-related  70.63 
 
 		 423 aa  558  1e-158  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2245  GTP-binding protein, HSR1-related  71.6 
 
 		 435 aa  545  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.157865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1450  small GTP-binding protein  67.48 
 
 		 447 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0438949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2844  putative GTP-binding protein  67.48 
 
 		 416 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1494  GTP-binding protein, HSR1-related  67.23 
 
 		 448 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.172375 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4123  small GTP-binding protein  69.19 
 
 		 435 aa  504  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.214153  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4392  small GTP-binding protein  59.42 
 
 		 457 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  57.68 
 
 		 444 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  57.18 
 
 		 441 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1820  GTP-binding proten HflX  56.93 
 
 		 441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332414  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1526  GTP-binding proten HflX  57.84 
 
 		 466 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0068  GTP-binding proten HflX  57.18 
 
 		 474 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.943914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2825  GTP-binding proten HflX  58.44 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3052  GTP-binding proten HflX  58.44 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2943  GTP-binding proten HflX  58.94 
 
 		 471 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1761  GTP-binding protein, HSR1-related  57.59 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1494  GTP-binding proten HflX  57.61 
 
 		 470 aa  398  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0481  GTP-binding proten HflX  55.69 
 
 		 436 aa  393  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.738379  decreased coverage  0.000424503 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1096  GTP-binding protein HSR1-related  55.92 
 
 		 465 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.774913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6545  GTP-binding proten HflX  57.47 
 
 		 471 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  51.54 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5943  GTP-binding proten HflX  57.32 
 
 		 474 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2207  GTP-binding protein HSR1-related  57.07 
 
 		 472 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1685  small GTP-binding protein domain-containing protein  54.09 
 
 		 418 aa  386  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2583  GTP-binding protein, HSR1-related  55.53 
 
 		 461 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0894246  normal  0.17165 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1069  GTP-binding proten HflX  57.22 
 
 		 490 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3123  GTP-binding protein HSR1-related  55.09 
 
 		 474 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2595  GTP-binding protein, HSR1-related  53.94 
 
 		 434 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0536  GTP-binding proten HflX  57 
 
 		 469 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1110  GTP-binding protein, putative  56.81 
 
 		 472 aa  381  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.259751  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1450  GTP-binding protein, HSR1-related  55.64 
 
 		 442 aa  381  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.475087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2877  GTP-binding protein, HSR1-related  54.81 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1842  GTP-binding protein, HSR1-related  53.83 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  54.31 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2868  GTP-binding proten HflX  56.19 
 
 		 455 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4074  putative GTP-binding protein (hflX)  54.71 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0625  GTP-binding proten HflX  50.37 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00182649  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1271  GTP-binding protein, HSR1-related  51.67 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0252  GTP-binding protein, HSR1-related  52.26 
 
 		 442 aa  368  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.240813  normal  0.141615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2611  GTP-binding proten HflX  55.89 
 
 		 446 aa  365  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1932  small GTP-binding protein domain-containing protein  51.97 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  52.17 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  51.9 
 
 		 433 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  50.13 
 
 		 433 aa  330  4e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0278  GTP-binding protein, HSR1-related  48.29 
 
 		 432 aa  327  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.134684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  51.23 
 
 		 421 aa  316  4e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  47.66 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  48.56 
 
 		 433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  48.56 
 
 		 433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  48.56 
 
 		 433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  49.1 
 
 		 445 aa  311  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  46.91 
 
 		 417 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  48.47 
 
 		 414 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  48.47 
 
 		 414 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  49.43 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4941  GTP-binding protein HflX  49.59 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  46.35 
 
 		 429 aa  303  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  46.31 
 
 		 428 aa  301  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0573  GTP-binding protein, HSR1-related  49.32 
 
 		 433 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  45.89 
 
 		 461 aa  300  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  44.44 
 
 		 454 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  44.24 
 
 		 454 aa  300  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  47.67 
 
 		 441 aa  300  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4684  GTP-binding proten HflX  48.56 
 
 		 433 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  45.69 
 
 		 440 aa  298  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  45.5 
 
 		 429 aa  295  8e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  49.43 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  47.27 
 
 		 441 aa  293  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  43.43 
 
 		 415 aa  293  4e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1048  GTP-binding protein  46.09 
 
 		 454 aa  291  1e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0524  GTP-binding protein, HSR1-like  49.19 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0227372  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0940  GTP-binding proten HflX  46.09 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07550  GTP-binding protein HflX  48.64 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  45.29 
 
 		 450 aa  290  4e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  45.38 
 
 		 433 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  45.95 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  45.69 
 
 		 450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  45.23 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  48.14 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  44.96 
 
 		 429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  44.62 
 
 		 429 aa  282  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.31 
 
 		 436 aa  281  1e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  44.97 
 
 		 442 aa  281  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  44.29 
 
 		 489 aa  281  2e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  44.02 
 
 		 489 aa  280  3e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  46.48 
 
 		 435 aa  280  3e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  46.86 
 
 		 422 aa  280  3e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  46.42 
 
 		 426 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  46.42 
 
 		 426 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  45.18 
 
 		 432 aa  279  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  46.42 
 
 		 426 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  46.42 
 
 		 426 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  46.42 
 
 		 426 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  45.85 
 
 		 426 aa  279  8e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  46.18 
 
 		 426 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  45.38 
 
 		 431 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  43.87 
 
 		 439 aa  277  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  43.73 
 
 		 481 aa  276  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  45.85 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>