More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1536 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1536  phosphate transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 264 aa  547  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.424595  normal  0.394597 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  85.28 
 
 		 265 aa  473  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4327  phosphate transporter ATP-binding protein  84.15 
 
 		 265 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.172468  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2601  phosphate transporter ATP-binding protein  82.26 
 
 		 265 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  82.26 
 
 		 265 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1922  phosphate transporter ATP-binding protein  83.02 
 
 		 265 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2292  phosphate transporter ATP-binding protein  75.62 
 
 		 283 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0397  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  72.09 
 
 		 284 aa  401  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0601  phosphate transporter ATP-binding protein  73.79 
 
 		 248 aa  403  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.889031  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2279  phosphate transporter ATP-binding protein  74.4 
 
 		 275 aa  399  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0589752  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0481  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  74.3 
 
 		 263 aa  397  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.180726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0489  phosphate transporter ATP-binding protein  70.66 
 
 		 271 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3118  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  69.77 
 
 		 291 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0430987  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0181  phosphate transporter ATP-binding protein  72.29 
 
 		 271 aa  387  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0122  phosphate transporter ATP-binding protein  70.27 
 
 		 271 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.341225 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1074  phosphate transporter ATP-binding protein  72.36 
 
 		 247 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.566041  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3626  phosphate transporter ATP-binding protein  71.49 
 
 		 295 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.926867  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0171  phosphate transporter ATP-binding protein  71.89 
 
 		 271 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4548  phosphate transporter ATP-binding protein  69.57 
 
 		 302 aa  382  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1541  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  71.08 
 
 		 265 aa  381  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2406  ABC phosphate transporter ATP-binding protein  69.05 
 
 		 275 aa  383  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0506125 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0768  phosphate transporter ATP-binding protein  67.03 
 
 		 273 aa  378  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0255819  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2141  phosphate transporter ATP-binding protein  70.59 
 
 		 257 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2056  phosphate transporter ATP-binding protein  70.59 
 
 		 257 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12029  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3752  phosphate transporter ATP-binding protein  68.11 
 
 		 293 aa  377  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.600965 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0823  phosphate transporter ATP-binding protein  71.08 
 
 		 260 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511308 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1225  phosphate transporter ATP-binding protein  67.73 
 
 		 252 aa  372  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.315326  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1231  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  67.47 
 
 		 281 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.758755 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3315  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.61 
 
 		 290 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0283925  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  67.32 
 
 		 253 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  66.27 
 
 		 252 aa  358  6e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0469  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.78 
 
 		 254 aa  353  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1963  phosphate transporter ATP-binding protein  63.2 
 
 		 253 aa  352  4e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0092  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.49 
 
 		 255 aa  351  7e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.89 
 
 		 276 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  64.11 
 
 		 261 aa  346  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0622  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.05 
 
 		 269 aa  346  3e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.970932  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3638  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.85 
 
 		 267 aa  344  8e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000916154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  63.1 
 
 		 253 aa  343  1e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0607  phosphate transporter ATP-binding protein  63.1 
 
 		 253 aa  343  1e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.080383  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1856  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  57.25 
 
 		 273 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2660  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.99 
 
 		 253 aa  342  2.9999999999999997e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2104  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.81 
 
 		 252 aa  341  9e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  65.34 
 
 		 252 aa  340  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4154  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.66 
 
 		 272 aa  340  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.914841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4000  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.87 
 
 		 265 aa  339  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0354  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.89 
 
 		 301 aa  340  2e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0142036  normal  0.246241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3540  response regulator receiver protein  58.75 
 
 		 273 aa  340  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1137  phosphate transporter ATP-binding protein  65.2 
 
 		 285 aa  339  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0586  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.05 
 
 		 272 aa  339  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.518906 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0946  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.2 
 
 		 287 aa  339  2.9999999999999998e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.754172 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2650  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  63.24 
 
 		 285 aa  338  5e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.567129  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1479  phosphate ABC transporter permease  58.66 
 
 		 260 aa  338  5e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  62.75 
 
 		 256 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1236  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.75 
 
 		 286 aa  337  8e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.534632  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0498  phosphate ABC transporter permease  60.16 
 
 		 254 aa  337  9.999999999999999e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 251 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0486  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  58.96 
 
 		 251 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1919  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.42 
 
 		 253 aa  336  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.603751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2808  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  57.99 
 
 		 265 aa  336  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2548  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.65 
 
 		 292 aa  336  2.9999999999999997e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1483  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.89 
 
 		 249 aa  335  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0910  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.08 
 
 		 305 aa  336  2.9999999999999997e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2396  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  60.59 
 
 		 283 aa  335  3.9999999999999995e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.6 
 
 		 251 aa  335  5e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1569  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.76 
 
 		 251 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4003  phosphate transporter ATP-binding protein  63.45 
 
 		 262 aa  334  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4119  phosphate transporter ATP-binding protein  63.45 
 
 		 262 aa  334  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1376  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.24 
 
 		 260 aa  334  9e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000114898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1617  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.75 
 
 		 284 aa  334  9e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336518  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.35 
 
 		 252 aa  333  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.376922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0709  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.05 
 
 		 251 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  60.64 
 
 		 249 aa  333  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0093  phosphate transporter ATP-binding protein  62.9 
 
 		 284 aa  333  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1416  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.35 
 
 		 251 aa  333  2e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00175163  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1242  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.35 
 
 		 286 aa  333  2e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.867725  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0350  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.36 
 
 		 251 aa  333  2e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000161831 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1041  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.16 
 
 		 284 aa  333  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000353293  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3160  phosphate transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 		 258 aa  332  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0749  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  60.56 
 
 		 255 aa  332  4e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000330265  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  62.06 
 
 		 255 aa  332  4e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4145  phosphate transporter ATP-binding protein  63.05 
 
 		 262 aa  332  5e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  61.26 
 
 		 272 aa  331  9e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0505  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.33 
 
 		 276 aa  330  1e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.497855 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  62 
 
 		 253 aa  330  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0379  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.76 
 
 		 254 aa  329  3e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.198087  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2983  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.45 
 
 		 253 aa  329  3e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1359  phosphate transporter ATP-binding protein  61.51 
 
 		 272 aa  329  3e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0675287  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  60.87 
 
 		 277 aa  328  4e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3166  phosphate transporter ATP-binding protein  61.51 
 
 		 272 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2743  phosphate transporter ATP-binding protein  59.92 
 
 		 272 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0333  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.11 
 
 		 306 aa  328  6e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_149  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  60.56 
 
 		 251 aa  327  8e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2278  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.24 
 
 		 253 aa  327  9e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1503  phosphate transporter ATP-binding protein  61.11 
 
 		 272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.529486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1595  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.54 
 
 		 301 aa  327  1.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0289  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.71 
 
 		 288 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6145  phosphate transporter ATP-binding protein  59.29 
 
 		 277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70810  phosphate transporter ATP-binding protein  59.29 
 
 		 277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.356471 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1679  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.69 
 
 		 286 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0234903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>