More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1466 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  100 
 
 		 345 aa  694    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  80.75 
 
 		 348 aa  531  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  80.58 
 
 		 343 aa  523  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  76.23 
 
 		 344 aa  498  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  74.49 
 
 		 342 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  74.49 
 
 		 342 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  74.2 
 
 		 359 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  72.19 
 
 		 348 aa  444  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  70.06 
 
 		 349 aa  437  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  70.15 
 
 		 341 aa  433  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  67.54 
 
 		 342 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  70.15 
 
 		 371 aa  433  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  66.96 
 
 		 344 aa  433  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  70 
 
 		 341 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  70.36 
 
 		 336 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  69.72 
 
 		 351 aa  424  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.48 
 
 		 342 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  70.5 
 
 		 346 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  65.76 
 
 		 339 aa  421  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  63.87 
 
 		 349 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  64.64 
 
 		 343 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  64.97 
 
 		 354 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  63.37 
 
 		 358 aa  413  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  62.29 
 
 		 353 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.48 
 
 		 344 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  66.46 
 
 		 356 aa  411  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  68.11 
 
 		 364 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  63.28 
 
 		 391 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  62.29 
 
 		 353 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  63.88 
 
 		 353 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  65.22 
 
 		 358 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  62.29 
 
 		 350 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  65.87 
 
 		 364 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.48 
 
 		 344 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.48 
 
 		 344 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.72 
 
 		 348 aa  398  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  68.45 
 
 		 366 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  62.95 
 
 		 332 aa  393  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  58.5 
 
 		 348 aa  370  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  57.68 
 
 		 345 aa  358  6e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  57.14 
 
 		 387 aa  329  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  54.67 
 
 		 352 aa  323  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.21 
 
 		 340 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  53.03 
 
 		 365 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.58 
 
 		 356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  53.03 
 
 		 365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.3 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  51.59 
 
 		 372 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  51.59 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  51.59 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  51.59 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  53.01 
 
 		 390 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  51.59 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  51.59 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  51.59 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  52.37 
 
 		 397 aa  300  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  50.72 
 
 		 372 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  49.56 
 
 		 395 aa  299  4e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  49.14 
 
 		 379 aa  299  6e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 347 aa  298  7e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 341 aa  298  9e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  50.72 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  52.58 
 
 		 370 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  49.1 
 
 		 370 aa  298  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  50.59 
 
 		 373 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  47.73 
 
 		 361 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  50 
 
 		 397 aa  296  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  49.14 
 
 		 357 aa  296  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 364 aa  296  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  52.16 
 
 		 390 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  52.16 
 
 		 390 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  52.16 
 
 		 390 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  52.16 
 
 		 390 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 364 aa  295  6e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  50.29 
 
 		 358 aa  295  6e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  52.16 
 
 		 390 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  47.73 
 
 		 355 aa  295  7e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  51.37 
 
 		 373 aa  295  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  51.74 
 
 		 370 aa  295  8e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  51.37 
 
 		 370 aa  294  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  51.34 
 
 		 338 aa  294  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.9 
 
 		 434 aa  294  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  50.87 
 
 		 345 aa  294  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  49.12 
 
 		 341 aa  294  2e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.57 
 
 		 369 aa  294  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  47.43 
 
 		 364 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 366 aa  293  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  50 
 
 		 371 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  49.27 
 
 		 362 aa  293  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  50.61 
 
 		 338 aa  292  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  51.51 
 
 		 338 aa  291  8e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3472  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.004996  normal  0.428622 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 357 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.29 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1846  GTP1/OBG domain-containing protein  51.17 
 
 		 346 aa  291  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  51.01 
 
 		 392 aa  289  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  48.82 
 
 		 343 aa  289  5.0000000000000004e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  50.62 
 
 		 402 aa  289  5.0000000000000004e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 406 aa  288  8e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0486  GTPase ObgE  51 
 
 		 370 aa  288  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>