More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1259 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  59.88 
 
 		 841 aa  907    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  57.04 
 
 		 827 aa  860    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1259  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 834 aa  1632    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499676  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  43.03 
 
 		 805 aa  640    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  56.98 
 
 		 826 aa  867    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1661  heavy metal translocating P-type ATPase  57.65 
 
 		 825 aa  776    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119959  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  60.51 
 
 		 833 aa  892    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  57.95 
 
 		 832 aa  752    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  57.64 
 
 		 827 aa  856    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  59.19 
 
 		 829 aa  867    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  58.52 
 
 		 759 aa  811    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  64.2 
 
 		 836 aa  1030    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  43.9 
 
 		 798 aa  637    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  60.24 
 
 		 762 aa  845    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  64.2 
 
 		 836 aa  1030    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2890  copper-translocating P-type ATPase  59.55 
 
 		 813 aa  828    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  55.23 
 
 		 834 aa  852    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  45.81 
 
 		 750 aa  637    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  57.96 
 
 		 835 aa  874    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  45.35 
 
 		 868 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  58.28 
 
 		 839 aa  868    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  48.17 
 
 		 835 aa  700    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  58.85 
 
 		 833 aa  882    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  57.18 
 
 		 829 aa  803    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  48.71 
 
 		 811 aa  667    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2086  heavy metal translocating P-type ATPase  63 
 
 		 744 aa  835    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  56.72 
 
 		 827 aa  867    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1536  heavy metal translocating P-type ATPase  59.48 
 
 		 813 aa  845    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.627747 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  47.93 
 
 		 836 aa  668    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  55.31 
 
 		 841 aa  832    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  44.14 
 
 		 818 aa  660    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  43.99 
 
 		 797 aa  645    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  56.6 
 
 		 824 aa  727    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  59.66 
 
 		 767 aa  846    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2679  heavy metal translocating P-type ATPase  54.68 
 
 		 857 aa  825    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  53.61 
 
 		 838 aa  786    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  53.14 
 
 		 836 aa  806    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  54.32 
 
 		 833 aa  770    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  63.35 
 
 		 814 aa  982    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  60.37 
 
 		 762 aa  845    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  60.37 
 
 		 762 aa  845    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  53.81 
 
 		 826 aa  771    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2185  heavy metal translocating P-type ATPase  52.36 
 
 		 754 aa  648    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  55.53 
 
 		 838 aa  777    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  60.57 
 
 		 855 aa  911    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  40.59 
 
 		 889 aa  650    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  40.34 
 
 		 889 aa  644    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  48.71 
 
 		 811 aa  667    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  52.03 
 
 		 821 aa  743    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  58.77 
 
 		 841 aa  869    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2813  heavy metal translocating P-type ATPase  57.65 
 
 		 830 aa  753    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  57.8 
 
 		 852 aa  879    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  46.75 
 
 		 814 aa  639    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  60.37 
 
 		 762 aa  847    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  53.05 
 
 		 837 aa  798    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0521  heavy metal translocating P-type ATPase  55.4 
 
 		 807 aa  771    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1129  heavy metal translocating P-type ATPase  58.17 
 
 		 840 aa  831    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.979362 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  56.6 
 
 		 826 aa  878    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  53.88 
 
 		 856 aa  761    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2917  heavy metal translocating P-type ATPase  57.46 
 
 		 832 aa  761    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  60.61 
 
 		 840 aa  915    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  56.13 
 
 		 819 aa  862    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  41.09 
 
 		 815 aa  633  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  52.64 
 
 		 795 aa  629  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  45.54 
 
 		 753 aa  626  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  44.32 
 
 		 821 aa  624  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  41.18 
 
 		 794 aa  623  1e-177  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  42.72 
 
 		 797 aa  624  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  43.17 
 
 		 942 aa  624  1e-177  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  43.15 
 
 		 806 aa  622  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  43.62 
 
 		 839 aa  623  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  43.95 
 
 		 759 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  43.95 
 
 		 759 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  48.47 
 
 		 837 aa  622  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  52.4 
 
 		 724 aa  620  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  43.54 
 
 		 885 aa  620  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  48.14 
 
 		 831 aa  621  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  42.91 
 
 		 806 aa  619  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  51.36 
 
 		 737 aa  620  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  41.12 
 
 		 844 aa  620  1e-176  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  41.71 
 
 		 802 aa  615  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  50.91 
 
 		 846 aa  618  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  49.55 
 
 		 810 aa  616  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  44.73 
 
 		 782 aa  618  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  42.67 
 
 		 806 aa  617  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  45.39 
 
 		 752 aa  617  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  41.71 
 
 		 802 aa  615  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3504  heavy metal translocating P-type ATPase  52.63 
 
 		 743 aa  614  9.999999999999999e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  43.14 
 
 		 798 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  42.54 
 
 		 805 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  42.54 
 
 		 805 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  45.05 
 
 		 740 aa  615  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  42.04 
 
 		 857 aa  613  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  42.54 
 
 		 805 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  43.14 
 
 		 798 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 817 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  44.6 
 
 		 849 aa  612  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  42.42 
 
 		 805 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  51.8 
 
 		 806 aa  610  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  50.68 
 
 		 787 aa  611  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>