58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1236 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1236  DMSO reductase anchor subunit  100 
 
 		 295 aa  578  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.66345  normal  0.0462913 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1441  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  57.93 
 
 		 291 aa  324  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0769  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  45.36 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0146  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  34.16 
 
 		 349 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.345045 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0572  DMSO reductase chain C  36.1 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000032468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2644  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  38.84 
 
 		 312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.022311  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1677  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  38.1 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0495248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0338  hypothetical protein  30.86 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1741  hypothetical protein  33.65 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665621  normal  0.278657 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1999  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.02 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1934  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  37.06 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0057  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  31.8 
 
 		 327 aa  109  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4942  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.02 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743423  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4522  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.44 
 
 		 315 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.758783  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6212  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  34.15 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3813  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.17 
 
 		 310 aa  92.4  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.422428  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3108  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  32.6 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1447  DMSO reductase chain C  32.6 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2049  hypothetical protein  31.15 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3223  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  31.15 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1074  hypothetical protein  31.15 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2340  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  31.15 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58942  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1358  hypothetical protein  31.15 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0858  hypothetical protein  33.55 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1799  DMSO reductase anchor subunit  27.81 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00050464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3994  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.58 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195622  normal  0.0360257 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0426  putative dimethyl sulfoxide reductase anchor subunit  34.81 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.905194  hitchhiker  0.00000175345 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4697  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  40.18 
 
 		 277 aa  52.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.854228  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0549  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  37.76 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2786  putative dimethylsulfoxide reductase  37.01 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2680  putative anaerobic reductase component  37.01 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2723  putative dimethylsulfoxide reductase  37.01 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4694  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  39.29 
 
 		 277 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2767  putative anaerobic reductase component  37.01 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2898  putative anaerobic reductase component  37.01 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1739  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 551 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4688  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  35.38 
 
 		 275 aa  49.3  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000613246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1948  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  36.21 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1954  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  36.21 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2336  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  37.5 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2924  putative anaerobic DMSO reductase chain C anchor subunit  34 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00138794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2344  putative anaerobic reductase component  29.75 
 
 		 270 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.755425  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3392  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  36.73 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2961  phenylacetyl-CoA:acceptor oxidoreductase  31.97 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286998  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0920  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain C  36.73 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.809419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3259  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  36 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2352  aspartate carbamoyltransferase  42.31 
 
 		 615 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1689  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  35.51 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0746368 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1676  dmso reductase anchor subunit  33.33 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.088493  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0305  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.45 
 
 		 404 aa  43.9  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3745  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain C  33.62 
 
 		 273 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2253  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.04 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.285231  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1607  dmso reductase anchor subunit  33.33 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1843  dmso reductase anchor subunit  33.33 
 
 		 285 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.882429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1598  dmso reductase anchor subunit  33.33 
 
 		 285 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448472  normal  0.971647 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0572  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.09 
 
 		 398 aa  43.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1278  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  32.48 
 
 		 276 aa  42.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.394245  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1666  dmso reductase anchor subunit  32.43 
 
 		 285 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>