More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1147 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1147  processing peptidase  100 
 
 
426 aa  866    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1832  M16 family peptidase  68.99 
 
 
419 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0481  processing peptidase  68.99 
 
 
419 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130826  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0621  processing peptidase  67.31 
 
 
419 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3148  processing peptidase  66.27 
 
 
419 aa  570  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2329  peptidase  68.04 
 
 
420 aa  555  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124129  normal  0.969107 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4314  peptidase M16 domain-containing protein  62.38 
 
 
421 aa  535  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518498  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0678  peptidase M16 domain-containing protein  54.86 
 
 
424 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.614007  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4577  peptidase M16-like  50 
 
 
429 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1786  processing peptidase  47 
 
 
421 aa  365  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.41523  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0823  peptidase M16-like  48.07 
 
 
429 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0840  putative zinc protease  50 
 
 
429 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4796  peptidase M16-like  48.41 
 
 
429 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0908  peptidase M16 domain protein  48.68 
 
 
429 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0309  processing peptidase  46.57 
 
 
421 aa  360  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0115276 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0230  peptidase M16  49.47 
 
 
429 aa  360  3e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0263  peptidase M16-like  49.87 
 
 
429 aa  360  3e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.736782  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0269  peptidase M16 domain protein  45.56 
 
 
431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0721  peptidase M16 domain-containing protein  46.84 
 
 
421 aa  355  7.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2340  processing peptidase  46.38 
 
 
431 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.348853  normal  0.675898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3525  peptidase M16 domain-containing protein  45.67 
 
 
421 aa  351  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.855558  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  41.77 
 
 
423 aa  348  8e-95  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1252  peptidase M16 domain protein  45.93 
 
 
421 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3577  processing peptidase  44.71 
 
 
431 aa  339  5e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3253  processing peptidase  44.71 
 
 
431 aa  339  5e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3449  processing peptidase  44.23 
 
 
431 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847529  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3234  processing peptidase  48.03 
 
 
421 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1074  peptidase family M16  46.19 
 
 
434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0759  peptidase M16-like  44.02 
 
 
430 aa  333  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  39.23 
 
 
424 aa  331  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0235  M16 family peptidase  38.74 
 
 
421 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0535  processing peptidase  42.17 
 
 
434 aa  325  7e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0598  processing peptidase  45.77 
 
 
430 aa  325  9e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0411  M16 family peptidase  41.29 
 
 
422 aa  324  2e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.887609  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0488  zinc protease  43.53 
 
 
430 aa  323  3e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0964093  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0634  peptidase M16 domain protein  43.83 
 
 
432 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1589  processing peptidase  45.19 
 
 
431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0398438 
 
 
-
 
NC_004310  BR0483  processing protease  43.03 
 
 
430 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.678653  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0775  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  36.74 
 
 
421 aa  318  2e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0691  peptidase M16 domain protein  42.86 
 
 
432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0175  M16 family peptidase  39.76 
 
 
423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1907  peptidase M16 domain-containing protein  40 
 
 
419 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0978353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  40.54 
 
 
418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1309  peptidase M16 domain protein  40.29 
 
 
418 aa  302  9e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00910612  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2975  peptidase M16 domain protein  40.5 
 
 
418 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000177641 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  39.41 
 
 
413 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  38.01 
 
 
421 aa  296  4e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  39.58 
 
 
413 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  39.58 
 
 
413 aa  294  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  39.58 
 
 
413 aa  294  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  39.58 
 
 
413 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  39.58 
 
 
413 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  39.58 
 
 
413 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1190  peptidase M16 domain-containing protein  40.36 
 
 
477 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0547363  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  39.58 
 
 
413 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1594  M16 family peptidase  38.02 
 
 
418 aa  293  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.326709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  39.58 
 
 
413 aa  293  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3627  peptidase M16 domain-containing protein  39.31 
 
 
413 aa  293  4e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  37.87 
 
 
412 aa  293  6e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1507  peptidase M16 domain-containing protein  38.39 
 
 
451 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.583967  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2056  peptidase M16 domain protein  39.36 
 
 
413 aa  289  6e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1382  peptidase M16 domain-containing protein  39.36 
 
 
466 aa  288  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.975318  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  41.24 
 
 
435 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1340  peptidase M16 domain-containing protein  38.63 
 
 
462 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000321073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3554  processing peptidase  38.94 
 
 
467 aa  286  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106365  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2351  peptidase M16 domain-containing protein  37.61 
 
 
451 aa  286  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1519  peptidase M16 domain protein  41.94 
 
 
441 aa  286  5e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0910  processing peptidase  35.82 
 
 
422 aa  285  7e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1568  peptidase M16-like  36.41 
 
 
425 aa  285  8e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000011969  decreased coverage  0.00224891 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1592  peptidase M16-like  38.94 
 
 
418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0267121  normal  0.0196738 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1341  zinc protease, insulinase family  38.98 
 
 
399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.411991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1315  peptidase M16 domain protein  40.82 
 
 
418 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  36.23 
 
 
417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1414  processing peptidase  39.55 
 
 
410 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.186097 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  38.96 
 
 
420 aa  281  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0785  mitochondrial processing peptidase  40.19 
 
 
462 aa  280  5e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.346548  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1706  peptidase M16 domain protein  36.17 
 
 
411 aa  280  5e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.425033  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3176  peptidase M16 domain-containing protein  38.5 
 
 
453 aa  279  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3323  processing peptidase  40.57 
 
 
441 aa  279  8e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7875  processing peptidase  37.78 
 
 
439 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1562  Zn-dependent peptidase  36.97 
 
 
419 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000390885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1947  peptidase M16 domain-containing protein  37.41 
 
 
422 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141516  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1444  processing peptidase  38.61 
 
 
421 aa  278  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3953  peptidase M16 domain protein  39.81 
 
 
459 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870658  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  38.87 
 
 
438 aa  276  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4022  peptidase M16 domain-containing protein  36.32 
 
 
424 aa  276  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0571342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2101  peptidase M16-like protein  37.29 
 
 
429 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0527778  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2084  peptidase M16 domain-containing protein  37.29 
 
 
429 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2147  peptidase M16 domain-containing protein  37.29 
 
 
429 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0419  peptidase M16-like protein  33.82 
 
 
419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2133  peptidase M16 domain protein  41.24 
 
 
436 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.765752 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12795  zinc protease pepR  39.41 
 
 
438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2117  processing peptidase  40.62 
 
 
429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23370  predicted Zn-dependent peptidase  39.29 
 
 
441 aa  272  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0226628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14700  predicted Zn-dependent peptidase  38 
 
 
453 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.2427  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2477  peptidase M16 domain protein  38.2 
 
 
445 aa  270  5e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424609  normal  0.386088 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1467  peptidase M16 domain protein  39.2 
 
 
457 aa  269  5e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1839  processing peptidase  36.01 
 
 
432 aa  270  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  36.92 
 
 
422 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3582  peptidase M16 domain protein  40.38 
 
 
444 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>