More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1016 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1016  PhoH family protein  100 
 
 		 337 aa  683    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0442383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3873  hypothetical protein  76.42 
 
 		 339 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3599  hypothetical protein  76.12 
 
 		 346 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3284  PhoH family protein  76.12 
 
 		 346 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0700  PhoH-like protein  73 
 
 		 373 aa  495  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0188  PhoH-like protein  73.13 
 
 		 338 aa  494  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3692  PhoH family protein  72.05 
 
 		 375 aa  475  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3618  PhoH family protein  57.73 
 
 		 342 aa  363  3e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  55.76 
 
 		 351 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000833124 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0069  PhoH family protein  51.81 
 
 		 363 aa  340  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0287585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0438  phosphate starvation inducible protein  56.15 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  54.4 
 
 		 353 aa  338  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  54.66 
 
 		 333 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0030  PhoH family protein  51.94 
 
 		 349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  54.04 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0018  PhoH family protein  51.34 
 
 		 350 aa  332  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.28473 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2067  PhoH family protein  54.04 
 
 		 327 aa  332  4e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0591  PhoH-like protein, phosphate starvation inducible  51.94 
 
 		 344 aa  328  9e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0241  PhoH-like protein  51.37 
 
 		 351 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3920  PhoH-like protein  53.16 
 
 		 348 aa  323  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3771  PhoH-like protein  54.11 
 
 		 322 aa  322  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0395  PhoH family protein  53.65 
 
 		 343 aa  323  4e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0047  putative phosphate starvation-inducible protein, PhoH-like protein  51.23 
 
 		 345 aa  322  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0015  PhoH-like protein  49.55 
 
 		 349 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.945712  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0451  PhoH family protein  51.07 
 
 		 351 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0469  PhoH-like protein  51.38 
 
 		 352 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  50.77 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0981  PhoH-like protein  52.04 
 
 		 348 aa  316  3e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1811  PhoH family protein  52.47 
 
 		 379 aa  315  6e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147763  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2063  PhoH-like protein  52.27 
 
 		 335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.590057 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1458  PhoH family protein  47.9 
 
 		 341 aa  311  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2388  PhoH family protein  52.22 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  50 
 
 		 332 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3780  PhoH family protein  50.31 
 
 		 350 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.150452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  50.47 
 
 		 332 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  50.47 
 
 		 332 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  50.93 
 
 		 332 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  50.15 
 
 		 340 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0638  PhoH family protein  51.75 
 
 		 338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  50.15 
 
 		 340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  52.37 
 
 		 325 aa  306  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  52.83 
 
 		 330 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  48.26 
 
 		 347 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3181  PhoH family protein  51.08 
 
 		 365 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0246823  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1056  PhoH family protein  50.16 
 
 		 341 aa  305  5.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563658  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  49.23 
 
 		 334 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3301  lipoate synthase  50.77 
 
 		 364 aa  304  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0234  PhoH family protein  50 
 
 		 369 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  47.53 
 
 		 365 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  51.76 
 
 		 341 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3205  PhoH family protein  50.95 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4241  PhoH family protein  52.24 
 
 		 316 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  50.81 
 
 		 348 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2896  PhoH family protein  49.84 
 
 		 355 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.434704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09060  PhoH-like protein  50.47 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706372  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0892  PhoH family protein  50.3 
 
 		 359 aa  300  2e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.427486  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3573  phoH family protein  48.77 
 
 		 368 aa  300  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189544  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3529  PhoH family protein  50.63 
 
 		 368 aa  300  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0452  PhoH-like protein  51.38 
 
 		 331 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2813  PhoH family protein  48.31 
 
 		 359 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2905  PhoH family protein  48.31 
 
 		 359 aa  299  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.21329  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3400  PhoH family protein  50.47 
 
 		 368 aa  299  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  50.65 
 
 		 328 aa  299  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2721  PhoH-like protein  48.78 
 
 		 354 aa  299  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0238  PhoH-like protein  47.71 
 
 		 330 aa  299  5e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1183  PhoH family protein  50 
 
 		 337 aa  299  5e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  50.16 
 
 		 331 aa  298  6e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3239  putative phoH-like protein  50.91 
 
 		 338 aa  298  8e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0407  PhoH family protein  51.89 
 
 		 330 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1244  PhoH family protein  48.1 
 
 		 370 aa  298  1e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2713  PhoH family protein  48.93 
 
 		 356 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0492  PhoH family protein  50.97 
 
 		 335 aa  297  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.307318  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3701  PhoH family protein  50.97 
 
 		 335 aa  297  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.818626 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1353  PhoH family protein  50.64 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000248045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  50.16 
 
 		 319 aa  296  4e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1495  PhoH-like protein  48.72 
 
 		 323 aa  296  4e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0474  PhoH-like protein  50.47 
 
 		 322 aa  295  6e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1003  PhoH family protein  49.84 
 
 		 354 aa  295  7e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00802061  normal  0.173492 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1007  PhoH family protein  49.84 
 
 		 354 aa  295  7e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.109119  normal  0.0769537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4346  PhoH-like protein  49.54 
 
 		 340 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0682  PhoH family protein  48.4 
 
 		 323 aa  294  1e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1068  PhoH family protein  49.84 
 
 		 347 aa  294  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1218  PhoH family protein  49.38 
 
 		 351 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0284374  normal  0.476314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4805  PhoH-like protein  49.24 
 
 		 340 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  49.69 
 
 		 319 aa  293  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00447  ATP-binding protein  50.63 
 
 		 328 aa  293  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000644199  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4666  PhoH family protein  50.65 
 
 		 316 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  50.32 
 
 		 323 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3006  PhoH family protein  50 
 
 		 357 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.425195  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2916  PhoH family protein  50 
 
 		 357 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0010821  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1830  hypothetical protein  50 
 
 		 357 aa  293  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0604  PhoH family protein  49.41 
 
 		 348 aa  292  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0411  PhoH family protein  46.55 
 
 		 362 aa  292  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.234067 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1105  PhoH family protein  48.1 
 
 		 348 aa  292  6e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000125149 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0509  PhoH family protein  50.65 
 
 		 345 aa  291  8e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1180  PhoH family protein  49.22 
 
 		 355 aa  291  9e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3528  PhoH-like protein  48.66 
 
 		 340 aa  291  9e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.959961  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3697  PhoH family protein  48.43 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104563  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0995  PhoH-like protein  49.53 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0457768  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3330  PhoH family protein  47.54 
 
 		 357 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.128023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>