More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1015 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1015  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 		 181 aa  357  7e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00876846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0703  hypothetical protein  66.67 
 
 		 160 aa  204  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3874  hypothetical protein  54.6 
 
 		 167 aa  168  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0190  hypothetical protein  53.01 
 
 		 194 aa  164  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3693  hypothetical protein  51.85 
 
 		 174 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.607801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3598  hypothetical protein  54.6 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.313573  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3283  hypothetical protein  54.6 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.780852 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  48.47 
 
 		 162 aa  134  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  50.3 
 
 		 161 aa  131  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  43.9 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  47.37 
 
 		 158 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  47.37 
 
 		 158 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  47.31 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  47.31 
 
 		 161 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  44.64 
 
 		 162 aa  124  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  49.4 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  44.44 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  43.5 
 
 		 171 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  51.2 
 
 		 168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  48.09 
 
 		 168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  48.48 
 
 		 147 aa  114  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  42.11 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  43.45 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  44.22 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  40.23 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  46.01 
 
 		 185 aa  110  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  44.63 
 
 		 200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  46.54 
 
 		 169 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  44.67 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  42.2 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3035  hypothetical protein  40.85 
 
 		 160 aa  104  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  47.2 
 
 		 167 aa  104  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  46.03 
 
 		 158 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  47.52 
 
 		 159 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  41.62 
 
 		 154 aa  100  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  45.73 
 
 		 163 aa  100  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  43.2 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  43.2 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  44.8 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  46.09 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  44 
 
 		 154 aa  98.6  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  47.77 
 
 		 166 aa  98.6  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  42.86 
 
 		 176 aa  98.2  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  42.4 
 
 		 161 aa  97.8  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  40 
 
 		 155 aa  97.1  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  41.67 
 
 		 167 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  43.24 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  42.4 
 
 		 154 aa  96.3  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  42.06 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  43.98 
 
 		 159 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2290  metal-dependent hydrolase  44.8 
 
 		 149 aa  95.5  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  46.4 
 
 		 137 aa  94.4  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  42.06 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0598  conserved hypothetical protein TIGR00043  41.86 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0750  protein of unknown function UPF0054  41.86 
 
 		 165 aa  94  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.698652  hitchhiker  0.000447843 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0239  hypothetical protein  39.58 
 
 		 153 aa  93.2  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  40.48 
 
 		 153 aa  93.2  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0064  hypothetical protein  37.98 
 
 		 155 aa  92.4  3e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.50025  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  41.26 
 
 		 152 aa  92.4  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  41.27 
 
 		 156 aa  92.4  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  43.2 
 
 		 157 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  43.2 
 
 		 157 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  43.2 
 
 		 157 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  43.2 
 
 		 157 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  38.06 
 
 		 161 aa  92  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  40.94 
 
 		 160 aa  91.7  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  45.6 
 
 		 161 aa  92  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  40.48 
 
 		 157 aa  91.7  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  41.76 
 
 		 169 aa  91.7  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  40.48 
 
 		 156 aa  90.9  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  42.4 
 
 		 157 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0626  hypothetical protein  42.97 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0872327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  41.84 
 
 		 258 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0590  hypothetical protein  41.6 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  42.4 
 
 		 152 aa  89.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  41.55 
 
 		 258 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1971  hypothetical protein  45.54 
 
 		 185 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  36.51 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  41.55 
 
 		 258 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  42.4 
 
 		 152 aa  89.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  41.6 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  41.55 
 
 		 258 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  42.55 
 
 		 237 aa  89  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  43.2 
 
 		 157 aa  88.6  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  42.36 
 
 		 301 aa  89  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0588  putative metalloprotease  44.8 
 
 		 155 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1057  hypothetical protein  45.6 
 
 		 205 aa  87.8  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.593132  normal  0.761519 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40.85 
 
 		 261 aa  87.8  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40.85 
 
 		 261 aa  87.4  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00627  hypothetical protein  44 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2967  protein of unknown function UPF0054  44 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148763  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00618  hypothetical protein  44 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0688  putative metalloprotease  44 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000843713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2986  putative metalloprotease  44 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  45.3 
 
 		 171 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0706  putative metalloprotease  44 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.202381  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0681  putative metalloprotease  43.2 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0927  hypothetical protein  26.22 
 
 		 154 aa  86.7  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0752  putative metalloprotease  44 
 
 		 155 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0378397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  43.2 
 
 		 274 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>