More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1012 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0706  S-adenosylmethionine synthetase  82.91 
 
 		 393 aa  662    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1012  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 394 aa  810    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0193  S-adenosylmethionine synthetase  81.89 
 
 		 393 aa  649    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3877  S-adenosylmethionine synthetase  78.32 
 
 		 388 aa  600  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1873  S-adenosylmethionine synthetase  77.38 
 
 		 388 aa  603  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176283  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3595  S-adenosylmethionine synthetase  77.3 
 
 		 388 aa  594  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0230155  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3280  S-adenosylmethionine synthetase  77.3 
 
 		 388 aa  594  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.861099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5908  S-adenosylmethionine synthetase  70.56 
 
 		 392 aa  551  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4493  methionine adenosyltransferase  70.74 
 
 		 392 aa  548  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5288  methionine adenosyltransferase  69.54 
 
 		 392 aa  542  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1816  methionine adenosyltransferase  70 
 
 		 397 aa  535  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0159943  normal  0.205319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3306  methionine adenosyltransferase  69.64 
 
 		 391 aa  535  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1062  methionine adenosyltransferase  70.72 
 
 		 398 aa  535  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323236  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3629  Methionine adenosyltransferase  69.64 
 
 		 391 aa  535  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0654869  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3506  Methionine adenosyltransferase  69.64 
 
 		 391 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.996413  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4154  S-adenosylmethionine synthetase  67.65 
 
 		 398 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1588  S-adenosylmethionine synthetase  67.73 
 
 		 398 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1596  S-adenosylmethionine synthetase  67.49 
 
 		 398 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4546  S-adenosylmethionine synthetase  66.67 
 
 		 398 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2439  S-adenosylmethionine synthetase  67.35 
 
 		 388 aa  522  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5699  S-adenosylmethionine synthetase  67.16 
 
 		 399 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2378  S-adenosylmethionine synthetase  67.33 
 
 		 398 aa  519  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.989714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2753  S-adenosylmethionine synthetase  67.08 
 
 		 398 aa  519  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293666  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3623  S-adenosylmethionine synthetase  66.92 
 
 		 389 aa  521  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3776  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 		 389 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0013  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 		 412 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303357  normal  0.0988559 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0046  S-adenosylmethionine synthetase  66.99 
 
 		 426 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0624552  hitchhiker  0.00000000150767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0015  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 		 412 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616083 
 
 
-
 
NC_004310  BR2160  S-adenosylmethionine synthetase  64.59 
 
 		 421 aa  495  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00603906  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0752  S-adenosylmethionine synthetase  64.83 
 
 		 420 aa  495  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2072  S-adenosylmethionine synthetase  64.35 
 
 		 421 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0645702  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1249  S-adenosylmethionine synthetase  63.88 
 
 		 426 aa  487  1e-136  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0444  S-adenosylmethionine synthetase  65.04 
 
 		 412 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00664731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3924  S-adenosylmethionine synthetase  65.31 
 
 		 426 aa  481  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3373  S-adenosylmethionine synthetase  62.34 
 
 		 402 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.304144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0027  S-adenosylmethionine synthetase  61.54 
 
 		 407 aa  468  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3139  S-adenosylmethionine synthetase  60.25 
 
 		 406 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1054  S-adenosylmethionine synthetase  63.32 
 
 		 395 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0284  S-adenosylmethionine synthetase  60.75 
 
 		 401 aa  453  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1970  S-adenosylmethionine synthetase  60.3 
 
 		 395 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  56.81 
 
 		 383 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  57.44 
 
 		 383 aa  427  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  57.07 
 
 		 387 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  58.4 
 
 		 390 aa  427  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  56.56 
 
 		 383 aa  425  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  57.62 
 
 		 383 aa  425  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0136  S-adenosylmethionine synthetase  55.5 
 
 		 390 aa  422  1e-117  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  57.18 
 
 		 383 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  57.18 
 
 		 383 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  57.29 
 
 		 385 aa  422  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  57.18 
 
 		 383 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  56.3 
 
 		 383 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  56.3 
 
 		 383 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  56.3 
 
 		 383 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  56.3 
 
 		 383 aa  420  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  55.75 
 
 		 381 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  55.78 
 
 		 383 aa  418  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  56.04 
 
 		 383 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  56.41 
 
 		 385 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  56.15 
 
 		 382 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  55.04 
 
 		 383 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  55.53 
 
 		 383 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  54.82 
 
 		 389 aa  412  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  55.53 
 
 		 395 aa  412  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1999  S-adenosylmethionine synthetase  54.22 
 
 		 382 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0828  S-adenosylmethionine synthetase  53.92 
 
 		 388 aa  412  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.296122  normal  0.0311874 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0945  S-adenosylmethionine synthetase  51.95 
 
 		 393 aa  413  1e-114  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1179  Methionine adenosyltransferase  57.03 
 
 		 389 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  54.02 
 
 		 395 aa  413  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0018  S-adenosylmethionine synthetase  53.65 
 
 		 392 aa  414  1e-114  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0850  S-adenosylmethionine synthetase  54.18 
 
 		 388 aa  414  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.876069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3227  S-adenosylmethionine synthetase  55.7 
 
 		 382 aa  414  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.359365 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  54.36 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  54.36 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4967  S-adenosylmethionine synthetase  54.43 
 
 		 396 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  54.52 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  54.36 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0499  S-adenosylmethionine synthetase  53.92 
 
 		 396 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2004  S-adenosylmethionine synthetase  54.22 
 
 		 382 aa  411  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0126  S-adenosylmethionine synthetase  54.52 
 
 		 393 aa  408  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  54.36 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  54.04 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  54.52 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  55.5 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3252  S-adenosylmethionine synthetase  53.88 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  54.52 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05530  S-adenosylmethionine synthetase  54.82 
 
 		 396 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5016  S-adenosylmethionine synthetase  54.43 
 
 		 396 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330289 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  54.36 
 
 		 384 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  54.36 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  54.36 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  54.26 
 
 		 384 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4840  S-adenosylmethionine synthetase  54.43 
 
 		 396 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.905564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  54.36 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  54.36 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  53.85 
 
 		 384 aa  407  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  54.82 
 
 		 387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3880  S-adenosylmethionine synthetase  52.88 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356419  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  52.02 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3042  S-adenosylmethionine synthetase  54.43 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.983396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>