149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0999 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0999  bile acid:sodium symporter  100 
 
 
293 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0120798  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1257  bile acid:sodium symporter  82.25 
 
 
293 aa  478  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  34.59 
 
 
289 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  33.06 
 
 
305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  33.06 
 
 
305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  31.34 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  31.34 
 
 
297 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  31.95 
 
 
344 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  30.99 
 
 
297 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  31.84 
 
 
299 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  30.39 
 
 
319 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  30.67 
 
 
307 aa  123  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  32.1 
 
 
321 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  30.45 
 
 
321 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  30.31 
 
 
319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  29.05 
 
 
321 aa  118  9e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  31.71 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  31.03 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  32.48 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  29.33 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  30.17 
 
 
350 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  29.97 
 
 
340 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  32.72 
 
 
335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  31.34 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  31.05 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  30.11 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  31.9 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  31.6 
 
 
316 aa  113  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  31.17 
 
 
368 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2072  bile acid:sodium symporter  31.91 
 
 
285 aa  112  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.106303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3066  bile acid:sodium symporter  31.54 
 
 
297 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  32.08 
 
 
315 aa  112  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  32.79 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  27.89 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  34.73 
 
 
322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  34.21 
 
 
335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  31.48 
 
 
298 aa  109  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  33.06 
 
 
322 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  28.21 
 
 
318 aa  108  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  32.64 
 
 
301 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  32.5 
 
 
322 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  31.47 
 
 
322 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  31.07 
 
 
334 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  31.47 
 
 
322 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  32 
 
 
310 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  29.6 
 
 
292 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2679  bile acid:sodium symporter  29.56 
 
 
297 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401934  normal  0.860091 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  31.47 
 
 
322 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  31.47 
 
 
322 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  31.47 
 
 
322 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  33.2 
 
 
311 aa  106  5e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  27.8 
 
 
321 aa  105  9e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  31.51 
 
 
351 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  29.3 
 
 
299 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  29.71 
 
 
311 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  30 
 
 
325 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0796  bile acid:sodium symporter  27.2 
 
 
297 aa  102  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3303  bile acid:sodium symporter  26.5 
 
 
316 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  29.96 
 
 
329 aa  102  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  29.34 
 
 
312 aa  102  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  29.67 
 
 
318 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  29.41 
 
 
303 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  29.56 
 
 
311 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  28.11 
 
 
303 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  28.57 
 
 
303 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  28.11 
 
 
300 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  28.63 
 
 
303 aa  100  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0647  sodium-dependent transporter  28.32 
 
 
333 aa  100  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00310924  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  27.71 
 
 
308 aa  100  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  28.16 
 
 
325 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  28.1 
 
 
315 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  27.39 
 
 
334 aa  99.4  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  29.08 
 
 
326 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  27.71 
 
 
303 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  29.17 
 
 
314 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  32.34 
 
 
321 aa  97.4  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0630  bile acid:sodium symporter  30.4 
 
 
284 aa  97.1  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  31.54 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  29.34 
 
 
309 aa  94.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1642  bile acid:sodium symporter  31.53 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0689619  normal  0.549741 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  27.24 
 
 
323 aa  93.6  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4290  bile acid:sodium symporter  29.74 
 
 
292 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  29.92 
 
 
309 aa  92.8  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  29.44 
 
 
309 aa  92.8  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2582  bile acid:sodium symporter  30.47 
 
 
296 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2779  bile acid:sodium symporter  30.04 
 
 
296 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142136  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2861  P3 protein  29.24 
 
 
297 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.934917 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  40.52 
 
 
350 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  25.99 
 
 
303 aa  90.1  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34425  predicted protein  27.78 
 
 
358 aa  89.4  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  28.36 
 
 
321 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  30.42 
 
 
309 aa  89.4  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  28.47 
 
 
316 aa  89.4  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1312  Bile acid:sodium symporter  46.74 
 
 
320 aa  89  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  36.91 
 
 
328 aa  89  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  29.57 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  26.32 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  28.68 
 
 
319 aa  86.7  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17829  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  25.16 
 
 
351 aa  85.5  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00336169  normal  0.02899 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02093  P3 protein  29.27 
 
 
221 aa  85.5  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000002356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>