More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0930 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
575 aa  1107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  64.72 
 
 
572 aa  635  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  63.07 
 
 
562 aa  659  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  63.02 
 
 
561 aa  632  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  61.52 
 
 
566 aa  627  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  59.03 
 
 
541 aa  617  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  59.16 
 
 
572 aa  598  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  57.27 
 
 
558 aa  566  1e-160  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  59.38 
 
 
561 aa  553  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3972  sodium/hydrogen exchanger  72.04 
 
 
424 aa  514  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.806764  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  53.7 
 
 
551 aa  513  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  53.32 
 
 
595 aa  511  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  53.16 
 
 
546 aa  497  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  50.46 
 
 
547 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  47.8 
 
 
548 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  50.46 
 
 
547 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  49.91 
 
 
720 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  36.52 
 
 
566 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  48.82 
 
 
566 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  36.52 
 
 
566 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  1.10445e-08 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  39.45 
 
 
565 aa  388  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  36.35 
 
 
566 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  29.4 
 
 
592 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  30.84 
 
 
571 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.25 
 
 
575 aa  216  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  30.66 
 
 
577 aa  214  2e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2433  sodium/hydrogen exchanger  28.44 
 
 
578 aa  210  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  30.56 
 
 
576 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 
574 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  28.55 
 
 
574 aa  207  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  29.52 
 
 
581 aa  194  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  31.29 
 
 
674 aa  180  7e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  27.78 
 
 
682 aa  176  1e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  28.44 
 
 
648 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0193  sodium/hydrogen exchanger  29.54 
 
 
598 aa  169  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  28.17 
 
 
648 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  4.90638e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  28.17 
 
 
648 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  30.75 
 
 
457 aa  163  7e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  28.86 
 
 
649 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  27.53 
 
 
648 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  28.96 
 
 
648 aa  160  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  27.57 
 
 
666 aa  157  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2306  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.5 
 
 
524 aa  157  5e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  25.94 
 
 
775 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  7.97462e-07 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  29.14 
 
 
720 aa  156  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  27.91 
 
 
656 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  28.72 
 
 
664 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  26.87 
 
 
648 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4125  sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 
584 aa  155  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.688995  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  26.81 
 
 
649 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  27.26 
 
 
649 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  27.35 
 
 
648 aa  154  3e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  27.35 
 
 
648 aa  154  3e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004131  putative Glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  29.66 
 
 
529 aa  154  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  28.77 
 
 
668 aa  154  6e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  25.9 
 
 
662 aa  154  6e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  27.05 
 
 
648 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  27.19 
 
 
561 aa  152  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.19 
 
 
567 aa  152  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  26.69 
 
 
658 aa  151  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  3.81991e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  28.94 
 
 
673 aa  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  27.01 
 
 
561 aa  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.2 
 
 
697 aa  150  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  25.24 
 
 
650 aa  150  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  27.71 
 
 
653 aa  150  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  26.97 
 
 
650 aa  149  1e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0188  sodium/hydrogen exchanger  27.31 
 
 
624 aa  148  2e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261815  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  28.57 
 
 
670 aa  149  2e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  2.5266e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2952  Sodium/hydrogen exchanger, TrkA-N  27.49 
 
 
568 aa  148  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  26.65 
 
 
562 aa  148  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  1.31586e-05 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  26.82 
 
 
567 aa  148  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4111  sodium/hydrogen exchanger  27.31 
 
 
528 aa  147  4e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49336e-06 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  27.9 
 
 
636 aa  147  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  26.39 
 
 
567 aa  147  8e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  28.01 
 
 
584 aa  146  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  26.51 
 
 
563 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01333  hypothetical protein  29.14 
 
 
529 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  27.11 
 
 
741 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  26.89 
 
 
566 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  27.49 
 
 
649 aa  144  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  26.23 
 
 
657 aa  143  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1105  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.87 
 
 
553 aa  143  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.79 
 
 
663 aa  143  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.6 
 
 
654 aa  143  1e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  26.33 
 
 
563 aa  142  1e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  26.92 
 
 
664 aa  142  1e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  26.28 
 
 
562 aa  142  2e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  27.08 
 
 
654 aa  141  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  25.81 
 
 
563 aa  141  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  4.02209e-08 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  24.56 
 
 
671 aa  141  4e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  26.27 
 
 
555 aa  140  5e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  27.67 
 
 
665 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  24.82 
 
 
762 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  29.35 
 
 
567 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  27.65 
 
 
585 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1225  potassium efflux system protein  26.37 
 
 
642 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.403013  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  29.51 
 
 
666 aa  139  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0610  sodium/hydrogen exchanger  28.47 
 
 
542 aa  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.554486  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  26.45 
 
 
672 aa  137  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  25.98 
 
 
586 aa  137  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>