More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0877 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2822  extracellular solute-binding protein  68.41 
 
 		 517 aa  635    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.687608  normal  0.0566169 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  79.57 
 
 		 524 aa  739    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0877  4-phytase  100 
 
 		 460 aa  936    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  42.76 
 
 		 528 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  43.94 
 
 		 526 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  41.99 
 
 		 527 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  45.82 
 
 		 527 aa  371  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  41.77 
 
 		 526 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  40.47 
 
 		 538 aa  364  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  41.45 
 
 		 531 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  40.3 
 
 		 526 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  39.4 
 
 		 532 aa  342  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2819  extracellular solute-binding protein  40.73 
 
 		 529 aa  341  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000112764  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  39.83 
 
 		 544 aa  338  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1815  extracellular solute-binding protein  40.77 
 
 		 532 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  37.88 
 
 		 528 aa  333  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  37.88 
 
 		 528 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  38.01 
 
 		 528 aa  332  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0688  extracellular solute-binding protein  40.22 
 
 		 523 aa  329  7e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110035  normal  0.066295 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0666  extracellular solute-binding protein family 5  40.22 
 
 		 523 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.404568  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1097  putative binding-dependent transport protein (periplasmic)  38.68 
 
 		 528 aa  322  8e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  36.88 
 
 		 526 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  36.88 
 
 		 526 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0422  extracellular solute-binding protein  40.73 
 
 		 527 aa  314  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147362  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  37.86 
 
 		 516 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  37.77 
 
 		 530 aa  310  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  38.36 
 
 		 556 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0423  extracellular solute-binding protein  39.19 
 
 		 527 aa  306  4.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204725  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  38.78 
 
 		 595 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  37.36 
 
 		 528 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  37.31 
 
 		 526 aa  282  7.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  36.22 
 
 		 526 aa  282  9e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  36 
 
 		 514 aa  281  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  36.64 
 
 		 531 aa  281  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  34.95 
 
 		 520 aa  280  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  36.75 
 
 		 517 aa  280  5e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  36.73 
 
 		 542 aa  279  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  35.41 
 
 		 520 aa  276  5e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  36.44 
 
 		 520 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  36.89 
 
 		 519 aa  271  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  37.11 
 
 		 517 aa  270  5.9999999999999995e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  34.73 
 
 		 518 aa  269  7e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2474  extracellular solute-binding protein  36.21 
 
 		 525 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  34.97 
 
 		 520 aa  267  4e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  34.39 
 
 		 514 aa  263  6.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  32.02 
 
 		 528 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  33.99 
 
 		 524 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  32.53 
 
 		 509 aa  237  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 		 535 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  33.12 
 
 		 533 aa  233  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  32.17 
 
 		 514 aa  233  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  33.55 
 
 		 530 aa  232  9e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  31.43 
 
 		 535 aa  232  9e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 		 533 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  33.33 
 
 		 525 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  32.98 
 
 		 515 aa  228  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  33.12 
 
 		 516 aa  225  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 		 531 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  32.44 
 
 		 522 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  32.44 
 
 		 526 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  32.98 
 
 		 538 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  32.15 
 
 		 549 aa  222  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  32.55 
 
 		 532 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  32.34 
 
 		 532 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.14 
 
 		 521 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  31.51 
 
 		 528 aa  217  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  32.39 
 
 		 512 aa  217  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  32.26 
 
 		 516 aa  217  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  31.7 
 
 		 521 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  32 
 
 		 527 aa  203  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1240  extracellular solute-binding protein  31.53 
 
 		 544 aa  195  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.602045  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  30.99 
 
 		 537 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.21 
 
 		 534 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.08 
 
 		 535 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  32.19 
 
 		 534 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  32.19 
 
 		 534 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  31.18 
 
 		 512 aa  166  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.26 
 
 		 510 aa  160  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  31.32 
 
 		 505 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 528 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  31.32 
 
 		 528 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  29.12 
 
 		 532 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 509 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  27.57 
 
 		 499 aa  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 		 510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  29.98 
 
 		 516 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  28.28 
 
 		 502 aa  147  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  30.86 
 
 		 523 aa  147  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.57 
 
 		 520 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  30.39 
 
 		 524 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  26.8 
 
 		 497 aa  145  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 523 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 509 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 		 495 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  24.31 
 
 		 521 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.31 
 
 		 521 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.77 
 
 		 521 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 521 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  24.31 
 
 		 521 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.63 
 
 		 520 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>