More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0847 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 352 aa  682    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  73.01 
 
 		 352 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  72.8 
 
 		 355 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  73.94 
 
 		 354 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  73.94 
 
 		 354 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  65.52 
 
 		 348 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  66.57 
 
 		 352 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.56 
 
 		 354 aa  319  5e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.72 
 
 		 362 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.12 
 
 		 364 aa  315  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.28 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.28 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  54.05 
 
 		 348 aa  311  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.59 
 
 		 362 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.86 
 
 		 362 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.31 
 
 		 363 aa  309  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.83 
 
 		 367 aa  308  8e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.63 
 
 		 356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  53.45 
 
 		 374 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.29 
 
 		 364 aa  306  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.63 
 
 		 356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.11 
 
 		 362 aa  302  7.000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.01 
 
 		 364 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.3 
 
 		 363 aa  302  7.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.97 
 
 		 349 aa  297  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.29 
 
 		 364 aa  296  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.58 
 
 		 364 aa  293  3e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 		 364 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.58 
 
 		 364 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.29 
 
 		 364 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.78 
 
 		 358 aa  292  6e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.19 
 
 		 358 aa  292  6e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.03 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.07 
 
 		 358 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.88 
 
 		 357 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.74 
 
 		 358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  48.17 
 
 		 384 aa  285  9e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.51 
 
 		 355 aa  278  1e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.44 
 
 		 354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  46.86 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.72 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  47.21 
 
 		 356 aa  273  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  46.02 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.47 
 
 		 343 aa  269  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  43.23 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.77 
 
 		 340 aa  266  4e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.28 
 
 		 360 aa  265  8e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48900  predicted protein  41.1 
 
 		 456 aa  265  8.999999999999999e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  47.08 
 
 		 349 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  45.11 
 
 		 357 aa  264  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.16 
 
 		 351 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.83 
 
 		 348 aa  263  4e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.11 
 
 		 335 aa  263  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  48.39 
 
 		 361 aa  263  4.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  46.27 
 
 		 340 aa  262  6e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  45.82 
 
 		 363 aa  262  6.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  49.2 
 
 		 367 aa  261  8.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.87 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.43 
 
 		 350 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.31 
 
 		 348 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  44.04 
 
 		 339 aa  258  8e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.24 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.24 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.24 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2205  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.53 
 
 		 357 aa  256  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  49.31 
 
 		 370 aa  256  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.05 
 
 		 344 aa  256  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.89 
 
 		 361 aa  256  5e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.28 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.94 
 
 		 363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.22 
 
 		 350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.99 
 
 		 349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.94 
 
 		 361 aa  253  3e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2138  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.67 
 
 		 344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.43 
 
 		 357 aa  252  8.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0940  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.14 
 
 		 350 aa  252  8.000000000000001e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.365408  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  48.01 
 
 		 363 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  48.01 
 
 		 363 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.59 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.3 
 
 		 376 aa  250  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  47.14 
 
 		 361 aa  250  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.11 
 
 		 340 aa  249  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.39 
 
 		 358 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.69 
 
 		 364 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.98 
 
 		 393 aa  249  5e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.13 
 
 		 377 aa  249  6e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.33 
 
 		 344 aa  248  9e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2665  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.34 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1080  Dihydroorotate oxidase  45.32 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106041  normal  0.333003 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0178  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.35 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  45.32 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.78 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2611  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.34 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1055  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.73 
 
 		 345 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.64 
 
 		 344 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  44.54 
 
 		 361 aa  247  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.41 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  43.38 
 
 		 355 aa  246  3e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2144  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.85 
 
 		 354 aa  246  4e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  43.07 
 
 		 346 aa  246  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>