More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0649 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  100 
 
 		 114 aa  222  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3877  hypothetical protein  78.95 
 
 		 114 aa  172  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.598756  normal  0.10934 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2366  hypothetical protein  74.56 
 
 		 114 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242324  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0711  hypothetical protein  74.56 
 
 		 114 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0520  hypothetical protein  72.81 
 
 		 114 aa  164  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149206  normal  0.329373 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0165  hypothetical protein  69.3 
 
 		 114 aa  157  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3648  hypothetical protein  70.18 
 
 		 113 aa  153  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.801413  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3143  hypothetical protein  52.38 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1811  hypothetical protein  51.43 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.82325  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  51.43 
 
 		 107 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  51.43 
 
 		 107 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4751  hypothetical protein  51.43 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4242  hypothetical protein  50.48 
 
 		 107 aa  103  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.744813  hitchhiker  0.0034155 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  54.05 
 
 		 108 aa  103  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  49.07 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  47.27 
 
 		 111 aa  103  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  50.94 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  100  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  46.67 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  98.6  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  48.18 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  46.23 
 
 		 108 aa  98.6  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  48.65 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  98.6  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  50.48 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  97.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  97.4  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  49.06 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  45.95 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1509  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  96.7  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000444013  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1122  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2243  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0461553  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2205  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0750998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1360  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1850  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00325862  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2372  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2220  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187397  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0046  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  47.75 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  47.75 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  47.75 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  47.75 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3645  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1826  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0162529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  47.17 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  47.75 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  47.75 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1827  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.878322  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  48.11 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  47.75 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  47.75 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  47.75 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  47.75 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0275  hypothetical protein  48.57 
 
 		 107 aa  95.1  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.08475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  47.75 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2360  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0900418  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  47.75 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  47.75 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  49.07 
 
 		 111 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  47.17 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  48.65 
 
 		 109 aa  94.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2301  hypothetical protein  49.06 
 
 		 109 aa  94.4  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177847  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  47.75 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1857  hypothetical protein  48.65 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1400  hypothetical protein  48.11 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851701  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  49.06 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2128  hypothetical protein  49.06 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144377  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  49.06 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  47.27 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  47.75 
 
 		 109 aa  94  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  48.11 
 
 		 111 aa  93.6  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000151444  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  46.85 
 
 		 109 aa  93.6  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2253  hypothetical protein  48.11 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393048  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2445  hypothetical protein  48.11 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0022  hypothetical protein  48.57 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121154  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0255  hypothetical protein  48.98 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  48.11 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000245202  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0033  hypothetical protein  47.62 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0434672  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  46.85 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  48.11 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  48.11 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000205784  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  48.11 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0033  hypothetical protein  47.62 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124063  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0436  hypothetical protein  45.71 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.562382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  47.17 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  47.17 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  47.22 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  47.22 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  47.22 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  48.98 
 
 		 102 aa  90.9  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  46.6 
 
 		 106 aa  90.9  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  42.98 
 
 		 107 aa  90.5  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1192  hypothetical protein  49.11 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  0.460114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>