168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0635 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0635  putative sulfate permease with cyclic nucleotide-binding domain  100 
 
 		 733 aa  1410    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0466798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5025  cyclic nucleotide-binding  31.07 
 
 		 749 aa  233  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0554599  normal  0.33022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0030  sulfate transporter  29.45 
 
 		 734 aa  224  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127752  normal  0.27039 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3069  hypothetical protein  23.36 
 
 		 721 aa  214  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2926  hypothetical protein  24.28 
 
 		 721 aa  212  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  24.8 
 
 		 739 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1175  sulphate transporter  26.86 
 
 		 730 aa  198  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0317024  normal  0.332491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1111  cyclic nucleotide-binding  25.48 
 
 		 729 aa  193  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.804267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1342  cyclic nucleotide-binding  29.03 
 
 		 731 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0366  putative sulfate transporter  25.63 
 
 		 727 aa  145  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.972082  normal  0.273026 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00680  vacuole protein, putative  24.25 
 
 		 1177 aa  107  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0220987  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03665  sulfate transporter family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12440)  23.89 
 
 		 1053 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42556  predicted protein  24.12 
 
 		 964 aa  105  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162025  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3904  cyclic nucleotide-binding:Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  23.74 
 
 		 736 aa  100  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50075  predicted protein  22.21 
 
 		 955 aa  99.4  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85698  sulfate transporter Sulfate/bicarbonate/oxalate exchanger SAT-1 and related transporters (SLC26 family)  22.84 
 
 		 963 aa  93.6  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.525688 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02853  low affinity sulfate transporter  27.03 
 
 		 545 aa  93.2  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002556  sulfate permease family protein  25.41 
 
 		 556 aa  90.1  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790014  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03456  hypothetical protein  23.67 
 
 		 562 aa  86.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42555  predicted protein  20.67 
 
 		 1159 aa  82.8  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.240204  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0119  sulfate permease family protein  24.42 
 
 		 548 aa  82.4  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  22.87 
 
 		 747 aa  73.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2050  sulphate transporter  24.04 
 
 		 571 aa  72.4  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.135317 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0754  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  25.06 
 
 		 573 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50333  predicted protein  24.18 
 
 		 619 aa  70.1  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0223  sulphate transporter  23.22 
 
 		 539 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.836452  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2305  sulphate transporter  24.1 
 
 		 549 aa  66.6  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0911  sulphate transporter  23.03 
 
 		 539 aa  66.6  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.791463  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1689  sulphate transporter  22.85 
 
 		 539 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  24.86 
 
 		 563 aa  66.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1617  sulfate permease family protein  24.76 
 
 		 521 aa  65.9  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0125947  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3320  putative sulfate transporter YchM  25.21 
 
 		 573 aa  65.1  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232868  hitchhiker  0.00197509 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1731  SulP family sulfate permease  20.78 
 
 		 551 aa  65.1  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.281721  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3253  putative sulfate transporter YchM  23.8 
 
 		 587 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237703 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0985  putative sulfate transporter  23.03 
 
 		 549 aa  63.5  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  26.86 
 
 		 575 aa  63.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07961  putative sulfate transporter  24.36 
 
 		 573 aa  63.9  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1037  putative sulfate transporter YchM  23.8 
 
 		 587 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1104  putative sulfate transporter YchM  23.8 
 
 		 587 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  23.85 
 
 		 583 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1459  SulP family sulfate permease  20.78 
 
 		 551 aa  62.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.032999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4288  sulphate transporter  25.41 
 
 		 554 aa  62  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2303  sulphate transporter  22.63 
 
 		 519 aa  62  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1138  putative sulfate transporter YchM  23.8 
 
 		 587 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0891  putative sulfate transporter  23.92 
 
 		 565 aa  61.6  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1042  putative sulfate transporter YchM  24.11 
 
 		 585 aa  61.2  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4725  sulphate transporter  22.56 
 
 		 561 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1231  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 521 aa  60.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0104  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  22.78 
 
 		 565 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2031  sulphate transporter  23.57 
 
 		 518 aa  60.1  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.62655  normal  0.79554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4452  sulphate transporter  24.39 
 
 		 495 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000256302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32829  SulP family transporter: sulfate; sulfate transporter of the Major Facilitator Superfamily (MFS)  25.4 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0671  sulfate transporter  22.99 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.045325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1592  sulphate transporter  23.9 
 
 		 519 aa  58.5  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.795484  normal  0.0437766 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1867  sulphate transporter  24.12 
 
 		 557 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0394  sulphate transporter  23.15 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1261  sulphate transporter  22.5 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2581  sulphate transporter  21.69 
 
 		 563 aa  57.4  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000213177  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1992  sulphate transporter  25 
 
 		 559 aa  57.8  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.998362 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1792  sulfate transporter  26.24 
 
 		 571 aa  57.4  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2232  putative sulfate transporter  25.42 
 
 		 515 aa  57  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2454  putative sulfate transporter YchM  23.91 
 
 		 565 aa  57  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1105  sulphate transporter  22.25 
 
 		 541 aa  57  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2061  putative sulfate transporter YchM  23.98 
 
 		 565 aa  57.4  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2174  putative sulfate transporter YchM  23.98 
 
 		 565 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0005  sulphate transporter  23.13 
 
 		 511 aa  56.2  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  22.84 
 
 		 568 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  22.8 
 
 		 577 aa  56.6  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  24.2 
 
 		 606 aa  56.6  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3912  cyclic nucleotide-binding protein  31.86 
 
 		 144 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0615  sulphate transporter  26.64 
 
 		 540 aa  54.7  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  30.97 
 
 		 158 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1067  putative sulfate transporter YchM  23.66 
 
 		 572 aa  54.7  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1911  sulphate transporter  22.81 
 
 		 497 aa  54.7  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1334  putative sulfate transporter YchM  26.32 
 
 		 574 aa  54.7  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.817877  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02920  hypothetical protein  24.86 
 
 		 519 aa  54.3  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4141  sulfate permease family protein  23.73 
 
 		 509 aa  54.3  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.284646  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2719  sulphate transporter  23.5 
 
 		 497 aa  53.9  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  27.27 
 
 		 624 aa  54.3  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2974  putative sulfate transporter YchM  25 
 
 		 590 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.117668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1709  sulphate transporter  23.56 
 
 		 519 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000377165  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  23.6 
 
 		 624 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1080  sulphate transporter  24.62 
 
 		 540 aa  52.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.610745  normal  0.0982504 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1315  sulphate transporter  21.52 
 
 		 520 aa  52.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1749  sulphate transporter  23.56 
 
 		 519 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000311132  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 227 aa  53.1  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2658  sulphate transporter  23.56 
 
 		 519 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000674443  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1754  sulfate permease family protein  22.1 
 
 		 536 aa  52.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0323665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0616  sulphate transporter  26.59 
 
 		 580 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012784 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2208  sulphate transporter  24.52 
 
 		 512 aa  52.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12953  Sulfate permease family protein  22.78 
 
 		 509 aa  52.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.215491  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02351  putative sulfate transporter  22.76 
 
 		 550 aa  52.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.779533  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3363  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  25.38 
 
 		 481 aa  52  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02441  putative sulfate transporter  22.76 
 
 		 551 aa  52  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0624614  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002987  sulfate permease  24.38 
 
 		 504 aa  52  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2505  sulphate transporter  23.47 
 
 		 519 aa  51.6  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3557  sulphate transporter  25.52 
 
 		 481 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179544 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1990  sulphate transporter  23.02 
 
 		 518 aa  51.6  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.638858  normal  0.0857546 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  28.99 
 
 		 229 aa  51.6  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  29.85 
 
 		 157 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>