115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0432 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0432  arginine deiminase  100 
 
 		 409 aa  845    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.277961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1975  arginine deiminase  57.8 
 
 		 413 aa  498  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68330  arginine deiminase  56.55 
 
 		 418 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0305167  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5911  arginine deiminase  56.55 
 
 		 418 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1090  arginine deiminase  55.72 
 
 		 419 aa  482  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2384  arginine deiminase  54.5 
 
 		 418 aa  471  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1108  arginine deiminase  55.53 
 
 		 416 aa  472  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2175  arginine deiminase  56.58 
 
 		 407 aa  471  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1145  arginine deiminase  54.26 
 
 		 418 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2128  arginine deiminase  54.26 
 
 		 418 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0244  arginine deiminase  54.26 
 
 		 418 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.177329  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1968  arginine deiminase  54.26 
 
 		 425 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1987  arginine deiminase  54.26 
 
 		 425 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0915  arginine deiminase  54.26 
 
 		 425 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.199485  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4537  arginine deiminase  54.5 
 
 		 418 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130916  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1585  arginine deiminase  54.01 
 
 		 425 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593064  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6443  arginine deiminase  53.85 
 
 		 417 aa  461  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4646  arginine deiminase  54.95 
 
 		 408 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2684  arginine deiminase  52.91 
 
 		 418 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2241  arginine deiminase  54.95 
 
 		 408 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.420551  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5202  arginine deiminase  54.21 
 
 		 409 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4223  arginine deiminase  54.72 
 
 		 417 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1038  arginine deiminase  54.96 
 
 		 417 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1000  arginine deiminase  54.83 
 
 		 419 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1001  arginine deiminase  54.48 
 
 		 417 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4386  arginine deiminase  52.8 
 
 		 418 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252294  normal  0.182376 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5575  arginine deiminase  55.45 
 
 		 405 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0746  arginine deiminase  53.71 
 
 		 407 aa  431  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0880775 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1877  arginine deiminase  54.11 
 
 		 405 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2424  arginine deiminase  52.88 
 
 		 431 aa  420  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0146  Arginine deiminase  52.07 
 
 		 418 aa  421  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.152156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1391  arginine deiminase  52.53 
 
 		 417 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00832109  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03644  arginine deiminase  45.59 
 
 		 406 aa  353  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4751  arginine deiminase  47.2 
 
 		 406 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4869  arginine deiminase  47.2 
 
 		 406 aa  352  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4721  arginine deiminase  46.96 
 
 		 406 aa  352  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.160752 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4850  arginine deiminase  47.2 
 
 		 406 aa  352  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002421  arginine deiminase  45.83 
 
 		 406 aa  351  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4814  arginine deiminase  46.96 
 
 		 406 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.514213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0452  arginine deiminase  46.72 
 
 		 406 aa  350  4e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0154087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3978  Arginine deiminase  42.99 
 
 		 419 aa  348  8e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0521  arginine deiminase  45.1 
 
 		 406 aa  345  8.999999999999999e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5730  Arginine deiminase  43.56 
 
 		 434 aa  345  8.999999999999999e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1993  arginine deiminase  45.81 
 
 		 409 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2800  Arginine deiminase  44.29 
 
 		 414 aa  334  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2842  arginine deiminase  46.59 
 
 		 407 aa  331  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06020  arginine deiminase  45.7 
 
 		 409 aa  314  1.9999999999999998e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6447  Arginine deiminase  41.54 
 
 		 401 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0096  Arginine deiminase  42 
 
 		 397 aa  298  9e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4276  arginine deiminase  41.28 
 
 		 399 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4362  arginine deiminase  41.28 
 
 		 399 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0268184 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4655  arginine deiminase  41.28 
 
 		 399 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1923  arginine deiminase  41.02 
 
 		 402 aa  293  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.849208  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1483  arginine deiminase  41.08 
 
 		 417 aa  292  7e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0245  Arginine deiminase  40.74 
 
 		 407 aa  286  4e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4517  arginine deiminase  40.24 
 
 		 419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00980  arginine deiminase  40.84 
 
 		 418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5027  arginine deiminase  40.35 
 
 		 436 aa  280  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0721497 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0058  arginine deiminase  35.64 
 
 		 407 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4810  arginine deiminase  40.78 
 
 		 402 aa  277  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0083  arginine deiminase  40.2 
 
 		 415 aa  269  8.999999999999999e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2250  arginine deiminase  33.66 
 
 		 411 aa  266  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11020  arginine deiminase  39.36 
 
 		 402 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00481648  normal  0.252626 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0166  arginine deiminase  39.02 
 
 		 407 aa  264  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2659  arginine deiminase  33.73 
 
 		 411 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2715  arginine deiminase  33.73 
 
 		 411 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1118  arginine deiminase  35.05 
 
 		 414 aa  262  1e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00592031  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12360  arginine deiminase  42.12 
 
 		 410 aa  261  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.440764  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0348  arginine deiminase  35.44 
 
 		 410 aa  260  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0420  arginine deiminase  35.44 
 
 		 410 aa  259  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4898  arginine deiminase  35.44 
 
 		 410 aa  259  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0472  arginine deiminase  35.19 
 
 		 410 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.861863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0341  arginine deiminase  35.19 
 
 		 410 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0407  arginine deiminase  35.19 
 
 		 410 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.751468 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3384  amidinotransferase  34.4 
 
 		 410 aa  250  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0483  arginine deiminase  33.66 
 
 		 408 aa  249  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000467571  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0451  arginine deiminase  32.93 
 
 		 410 aa  249  5e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131772  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06650  arginine deiminase  32.84 
 
 		 410 aa  246  4e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000122198  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1457  arginine deiminase  34.54 
 
 		 410 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00237571  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0445  arginine deiminase  32.92 
 
 		 410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000529267  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0089  arginine deiminase  35.94 
 
 		 403 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0871  arginine deiminase  33.01 
 
 		 410 aa  238  2e-61  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0203728  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22360  arginine deiminase  34.63 
 
 		 406 aa  236  6e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2163  arginine deiminase  33.33 
 
 		 410 aa  236  8e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0181  Arginine deiminase  34.31 
 
 		 405 aa  234  3e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1949  arginine deiminase  33.41 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000474348  normal  0.297072 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0902  arginine deiminase  31.39 
 
 		 406 aa  226  7e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0153  arginine deiminase  32.93 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0258  Arginine deiminase  31.46 
 
 		 401 aa  211  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0161  arginine deiminase  32.85 
 
 		 413 aa  206  7e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01620  arginine deiminase  31.89 
 
 		 407 aa  206  7e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000811385 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02360  arginine deiminase  31.67 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0263165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06540  arginine deiminase  31.89 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00222308  normal  0.406316 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0157  arginine deiminase  32.36 
 
 		 413 aa  200  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07960  arginine deiminase  32.93 
 
 		 403 aa  196  6e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000386602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2490  Arginine deiminase  33.03 
 
 		 420 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf873  arginine deiminase  32.3 
 
 		 409 aa  186  6e-46  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0565  Arginine deiminase  30.74 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0192  Arginine deiminase  28.1 
 
 		 501 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5777  Arginine deiminase  26.74 
 
 		 488 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>