More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0314 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  100 
 
 
109 aa  204  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  72.04 
 
 
154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0623  camphor resistance protein CrcB  75.27 
 
 
105 aa  124  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  61.54 
 
 
124 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  61.54 
 
 
124 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  49.06 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  44.55 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  47.22 
 
 
127 aa  80.1  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  44.86 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  50.52 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  43.93 
 
 
125 aa  76.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  51.06 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  47.87 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  43.93 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  48.81 
 
 
99 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  46.23 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  50.54 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  43.62 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  38.24 
 
 
128 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  48.98 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  53.01 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  47.78 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  46.32 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  55.42 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  50.53 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  41.11 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  55.42 
 
 
122 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  43.01 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  46 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  45.05 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  44.21 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  42.06 
 
 
270 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  47.78 
 
 
228 aa  64.3  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  40 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  44.09 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  37.96 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  44.09 
 
 
124 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  41.49 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  41.49 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  41.49 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  43.64 
 
 
124 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  36.78 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  42.2 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  45.68 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  40.38 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  38.27 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  36.46 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  38.32 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  39.78 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  39.78 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  32.14 
 
 
134 aa  58.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  39.78 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  39.78 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1326  crcB protein  37.5 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  37.74 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  36.94 
 
 
118 aa  57.8  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  40 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  39 
 
 
124 aa  57  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  41.11 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  44.58 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  35.05 
 
 
126 aa  57  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 
122 aa  57  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  38.89 
 
 
131 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  39.78 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  37.23 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0015  camphor resistance CrcB protein  33.7 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  43.01 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1465  CrcB protein  36 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  37.14 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  38.04 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  39.74 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  43.42 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1370  camphor resistance protein CrcB  36.61 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  38.89 
 
 
125 aa  55.5  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  40 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  41.94 
 
 
129 aa  56.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  41.98 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  36.79 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  41.98 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  41.98 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  42.53 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  42.53 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  40.91 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  41.98 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  41.98 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  41.98 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  41.98 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 
124 aa  55.1  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  39.36 
 
 
162 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  38.64 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  35.79 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  42.17 
 
 
129 aa  54.7  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  37.38 
 
 
124 aa  54.7  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  37.38 
 
 
124 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  40.23 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>