204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0172 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0172  precorrin-8X methylmutase  100 
 
 
512 aa  1007    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00890226  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2639  precorrin isomerase  49.8 
 
 
499 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0523957  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  66.83 
 
 
208 aa  263  6e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  66.34 
 
 
208 aa  258  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  65.85 
 
 
208 aa  257  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  65.69 
 
 
208 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  65.69 
 
 
208 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1244  precorrin-8X methylmutase  66.32 
 
 
208 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0926514  normal  0.29626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1670  precorrin-8X methylmutase  63.73 
 
 
209 aa  247  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793368  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1591  precorrin-8X methylmutase  66.32 
 
 
208 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257981 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3144  precorrin-8X methylmutase  65.28 
 
 
212 aa  243  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1646  precorrin-8X methylmutase  66.32 
 
 
208 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.996028  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1193  precorrin-8X methylmutase  66.32 
 
 
208 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0208289  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1673  precorrin-8X methylmutase  66.32 
 
 
208 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0355413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0605  precorrin-8X methylmutase  64.77 
 
 
208 aa  242  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.414575  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4823  precorrin-8X methylmutase  66.32 
 
 
208 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.183427 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1573  precorrin-8X methylmutase  66.32 
 
 
208 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1782  Precorrin-8X methylmutase  61.95 
 
 
208 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4828  precorrin-8X methylmutase  64.77 
 
 
208 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.504707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4706  precorrin-8X methylmutase  64.77 
 
 
208 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4618  precorrin-8X methylmutase  64.77 
 
 
208 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5370  precorrin-8X methylmutase  66.84 
 
 
208 aa  238  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218381  normal  0.626073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4884  precorrin-8X methylmutase  63.73 
 
 
208 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2399  precorrin-8X methylmutase  68.29 
 
 
208 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4572  precorrin-8X methylmutase  64.45 
 
 
208 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1569  precorrin-8X methylmutase  67.88 
 
 
208 aa  230  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0892973 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2991  precorrin-8X methylmutase  63.41 
 
 
208 aa  230  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  63.73 
 
 
732 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0575  Precorrin-8X methylmutase  57 
 
 
206 aa  228  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  59.02 
 
 
208 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  62.38 
 
 
209 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  58.21 
 
 
224 aa  226  8e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3284  precorrin-8X methylmutase  64.39 
 
 
211 aa  226  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174863  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  61.27 
 
 
209 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  58.42 
 
 
209 aa  224  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26500  precorrin-8X methylmutase  66.32 
 
 
208 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00589849  normal  0.995121 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0122  precorrin-8X methylmutase  60.1 
 
 
209 aa  221  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  59.7 
 
 
210 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1162  precorrin-8X methylmutase  67.36 
 
 
208 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00824413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2112  precorrin-8X methylmutase  67.36 
 
 
208 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.937061  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1603  precorrin-8X methylmutase  67.36 
 
 
208 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0559116  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  60.2 
 
 
210 aa  221  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0265  precorrin-8X methylmutase  67.36 
 
 
208 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.187916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1949  precorrin-8X methylmutase  67.36 
 
 
208 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1966  precorrin-8X methylmutase  67.36 
 
 
208 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000701969  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0895  precorrin-8X methylmutase  67.36 
 
 
208 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.182747  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2380  precorrin-8X methylmutase  63.24 
 
 
209 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1520  precorrin-8X methylmutase  58.85 
 
 
219 aa  219  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  58.71 
 
 
210 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1852  precorrin-8X methylmutase  57.51 
 
 
209 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.334862  normal  0.809538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3430  precorrin-8X methylmutase  57.95 
 
 
208 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193703  normal  0.583558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3146  precorrin-8X methylmutase  55.61 
 
 
210 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2249  precorrin-8X methylmutase  65.28 
 
 
208 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  57.69 
 
 
230 aa  209  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5850  precorrin-8X methylmutase  56.8 
 
 
209 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2488  precorrin-8X methylmutase  61.14 
 
 
208 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2533  precorrin-8X methylmutase  61.14 
 
 
208 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.466209  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2525  precorrin-8X methylmutase  61.14 
 
 
208 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.345603  normal  0.182328 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2212  precorrin-8X methylmutase  56.31 
 
 
209 aa  206  7e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  56.8 
 
 
221 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3105  precorrin-8X methylmutase  57.95 
 
 
208 aa  202  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.575803  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0340  precorrin-8X methylmutase  61.46 
 
 
209 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2534  precorrin-8X methylmutase  57.28 
 
 
209 aa  201  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474036  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0802  Precorrin-8X methylmutase  56.93 
 
 
217 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.172339  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1625  Precorrin-8X methylmutase  57.56 
 
 
221 aa  200  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2893  precorrin-8X methylmutase  55.61 
 
 
220 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2493  precorrin-8X methylmutase  60.53 
 
 
213 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2440  precorrin-8X methylmutase  57.89 
 
 
210 aa  196  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal  0.0714057 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1469  precorrin-8X methylmutase  60.1 
 
 
209 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6217  precorrin-8X methylmutase  59.61 
 
 
209 aa  195  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0665101  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2929  precorrin-8X methylmutase  53.69 
 
 
209 aa  195  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.451647  hitchhiker  0.00280569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1888  precorrin-8X methylmutase  57.59 
 
 
209 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1519  precorrin-8X methylmutase  59.61 
 
 
209 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.023292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1437  precorrin-8X methylmutase  57.71 
 
 
210 aa  192  9e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1434  Precorrin-8X methylmutase  58.21 
 
 
210 aa  192  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.656935  normal  0.667092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1712  Precorrin-8X methylmutase  56.72 
 
 
210 aa  190  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  hitchhiker  0.00790463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3266  Precorrin-8X methylmutase  54.72 
 
 
215 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0444754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2151  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  55.79 
 
 
210 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108715  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12101  precorrin-8X methylmutase  55.1 
 
 
208 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0138483  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2480  Precorrin-8X methylmutase  54.87 
 
 
208 aa  183  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182678  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  48.04 
 
 
221 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2191  Precorrin-8X methylmutase  54.37 
 
 
211 aa  179  9e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2422  precorrin-8X methylmutase  59.07 
 
 
208 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230932  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0152  Precorrin-8X methylmutase  54.19 
 
 
215 aa  176  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2455  putative molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB/unknown domain fusion protein  41.67 
 
 
452 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0879303  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2391  putative molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB/unknown domain fusion protein  41.81 
 
 
452 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5691  Precorrin-8X methylmutase  54.21 
 
 
210 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194408  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0737  putative molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB/unknown domain fusion protein  41.81 
 
 
452 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  42.76 
 
 
464 aa  172  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.538003  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3235  hypothetical protein  37.62 
 
 
305 aa  156  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.658837 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3752  hypothetical protein  43.15 
 
 
270 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0463  hypothetical protein  42.36 
 
 
277 aa  142  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.842135  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  43.78 
 
 
210 aa  135  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0292  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  47.74 
 
 
213 aa  134  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0342  precorrin-8X methylmutase  43.22 
 
 
220 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.81 
 
 
207 aa  126  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2253  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.89 
 
 
245 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  38.42 
 
 
209 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  38.42 
 
 
209 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0027  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.72 
 
 
230 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.615155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>