24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0161 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0161  possible cobalt transporter, subunit CbtA  100 
 
 		 229 aa  441  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.528614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2525  cobalt transporter, subunit CbtA  45.85 
 
 		 232 aa  181  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2222  cobalt transporter subunit CbtA, putative  46.08 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.338771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2532  cobalt transporter, subunit CbtA  35.86 
 
 		 228 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3101  cobalt transporter subunit CbtA, putative  34.63 
 
 		 233 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2354  cobalt transporter, subunit CbtA  34.93 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3152  hypothetical protein  35.32 
 
 		 240 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00956789  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6984  cobalt transporter, subunit CbtA  33.47 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2215  hypothetical protein  38.32 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2777  cobalt transporter, subunit CbtA  36.55 
 
 		 236 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0561965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4714  cobalt transporter, subunit CbtA  34.68 
 
 		 241 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3018  hypothetical protein  34.47 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.960935  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1440  cobalt transporter, subunit CbtA  33.75 
 
 		 258 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.473555 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25940  hypothetical protein  36.65 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00053463  normal  0.0606013 
 
 
-
 
NC_004310  BR1309  hypothetical protein  34.15 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.236923  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1272  hypothetical protein  34.15 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1874  cobalt transporter, subunit CbtA  30.92 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.245777  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3775  cobalt transporter, subunit CbtA  38.52 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.461264  normal  0.391945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2434  cobalt transporter, subunit CbtA  33.91 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.189525 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2301  hypothetical protein  38.06 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.395641  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1443  cobalt transporter, subunit CbtA  31.46 
 
 		 255 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.376445 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1718  cobalt transporter, subunit CbtA  32.42 
 
 		 255 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  0.0137404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3112  cobalt transporter, subunit CbtA  31.91 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0398133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2146  cobalt transporter, subunit CbtA  32.19 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>