More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0132 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  100 
 
 		 422 aa  834    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  71.7 
 
 		 421 aa  596  1e-169  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  71.46 
 
 		 423 aa  589  1e-167  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  72.88 
 
 		 424 aa  551  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  74.03 
 
 		 412 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  68.26 
 
 		 422 aa  533  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  72.88 
 
 		 424 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  54.93 
 
 		 442 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  57.01 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  54.91 
 
 		 442 aa  412  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  55.99 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  55.01 
 
 		 448 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  54.48 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  55.29 
 
 		 442 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  54.25 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  54.84 
 
 		 441 aa  405  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  55.01 
 
 		 448 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  56.09 
 
 		 441 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  56.06 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  52.53 
 
 		 447 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  57.24 
 
 		 447 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  52.28 
 
 		 432 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  53.26 
 
 		 438 aa  386  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  53.23 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  48.14 
 
 		 438 aa  368  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  53.16 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  48.48 
 
 		 442 aa  368  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  48.48 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  48.83 
 
 		 430 aa  358  8e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  46.44 
 
 		 470 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  49.88 
 
 		 447 aa  348  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  50.94 
 
 		 437 aa  342  5.999999999999999e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  51.08 
 
 		 437 aa  341  2e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  48.02 
 
 		 440 aa  335  7e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  45.48 
 
 		 442 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  46.17 
 
 		 442 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  43.79 
 
 		 440 aa  321  9.999999999999999e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  40.19 
 
 		 429 aa  315  9.999999999999999e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  41.83 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  47.03 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  43.37 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  46.51 
 
 		 435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  46.51 
 
 		 397 aa  298  9e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  46.56 
 
 		 443 aa  292  6e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  42.99 
 
 		 467 aa  291  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  38.88 
 
 		 442 aa  267  2.9999999999999995e-70  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  38.69 
 
 		 426 aa  225  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  37.13 
 
 		 422 aa  209  9e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.24 
 
 		 466 aa  209  9e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  34.3 
 
 		 429 aa  206  7e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  35.19 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  34.04 
 
 		 457 aa  205  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  36.05 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 		 441 aa  203  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  37.53 
 
 		 422 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  34.06 
 
 		 424 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  38.3 
 
 		 437 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  36.99 
 
 		 422 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  34.27 
 
 		 423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  34.51 
 
 		 423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  34.51 
 
 		 423 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  34.27 
 
 		 423 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  34.27 
 
 		 423 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  35.23 
 
 		 442 aa  196  9e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  38.81 
 
 		 424 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  36.63 
 
 		 427 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2045  FolC bifunctional protein  33.18 
 
 		 418 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0860305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  36.92 
 
 		 424 aa  193  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  33.81 
 
 		 443 aa  192  6e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  41.9 
 
 		 403 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  36.47 
 
 		 425 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  42.3 
 
 		 386 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2595  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  35.52 
 
 		 422 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.538955 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.25 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2553  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  35.28 
 
 		 422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  34.24 
 
 		 435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  34.24 
 
 		 437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  32.71 
 
 		 432 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3331  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  36.17 
 
 		 420 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0040495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  35.09 
 
 		 431 aa  190  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  35.83 
 
 		 412 aa  189  5.999999999999999e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2716  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  35.04 
 
 		 422 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  34.93 
 
 		 420 aa  188  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  36.43 
 
 		 416 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 		 432 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  32.86 
 
 		 432 aa  187  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  34.2 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  35.99 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  34.2 
 
 		 421 aa  187  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  37.93 
 
 		 424 aa  186  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  34.47 
 
 		 422 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  34.87 
 
 		 434 aa  186  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  32.61 
 
 		 418 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  34.42 
 
 		 438 aa  186  6e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2507  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  35.04 
 
 		 422 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1337  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  34.06 
 
 		 422 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.887259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2229  FolC bifunctional protein  36.98 
 
 		 441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369803  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 		 432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  34.06 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>