22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0100 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0100  putative transposase  100 
 
 		 627 aa  1276    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.733769 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3053  putative transposase  69.94 
 
 		 236 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3068  transposase protein  29.89 
 
 		 688 aa  152  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329621  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1665  transposase A  27.68 
 
 		 671 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2654  transposase, putative  28.34 
 
 		 669 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4525  Mu DNA binding I gamma subdomain  29.26 
 
 		 656 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3035  transposase protein  28.35 
 
 		 690 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277466  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1049  bacteriophage Mu transposase MuA  28.04 
 
 		 662 aa  127  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1279  integrase catalytic subunit  29.35 
 
 		 705 aa  123  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2121  integrase catalytic subunit  29.35 
 
 		 705 aa  123  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0650  transposase  28.09 
 
 		 667 aa  110  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0686157  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0787  transposase  28.09 
 
 		 667 aa  110  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000128606  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1264  Transposase-like Mu  26.47 
 
 		 728 aa  63.9  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000119608 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2907  integrase catalytic subunit  27.66 
 
 		 736 aa  60.8  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341428  normal  0.384956 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3350  bacteriophage transposase A protein, putative  25.1 
 
 		 708 aa  60.8  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4119  integrase catalytic subunit  30.67 
 
 		 736 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000332444 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0713  Transposase-like Mu  24.12 
 
 		 732 aa  52  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4214  Transposase-like Mu  25.78 
 
 		 665 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.497688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  30.61 
 
 		 548 aa  47.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0216  transposase  27.43 
 
 		 684 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1613  hypothetical protein  27.87 
 
 		 667 aa  44.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.564191  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3389  integrase catalytic subunit  21.81 
 
 		 689 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>