21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0095 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0095  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  623  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131989  normal  0.289582 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1607  Mu-like prophage major head subunit gpT  49.66 
 
 		 298 aa  317  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584098  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1637  hypothetical protein  49.34 
 
 		 303 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1304  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  44.63 
 
 		 298 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2096  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  44.63 
 
 		 298 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3001  major head subunit protein  42.95 
 
 		 298 aa  279  5e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1882  Mu-like prophage major head subunit  47.16 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3356  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  40.4 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4497  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  41.81 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0735  hypothetical protein  41.83 
 
 		 309 aa  250  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2098  prophage MuSo1, major head subunit, putative  41.28 
 
 		 306 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.168211  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2144  prophage MuSo1, major head subunit, putative  41.28 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0675  prophage MuSo1, major head subunit, putative  40.55 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0755  major head subunit  35.76 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0682  major head subunit  35.76 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2243  Mu-like prophage major head subunit gpT  35.99 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2685  prophage MuSo2, major head subunit, putative  34.63 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1962  major head subunit protein  45.14 
 
 		 299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.248362 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0952  Mu-like protein prophage major head subunit gpT-like protein  31.33 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000512523 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1974  Mu-like prophage major head subunit gpT  40 
 
 		 61 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2821  peptidase U35, phage prohead HK97  35.29 
 
 		 599 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.445416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>