42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0086 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0086  SOUL heme-binding protein  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0502327  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5978  heme-binding protein  40.82 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0157  SOUL heme-binding protein  47.13 
 
 		 179 aa  151  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2524  SOUL heme-binding protein  45.4 
 
 		 179 aa  148  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0864  hypothetical protein  45.09 
 
 		 197 aa  147  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1414  SOUL heme-binding protein  40.56 
 
 		 187 aa  141  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0404  SOUL heme-binding protein  40.31 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.460046  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1702  SOUL heme-binding protein  35.79 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.047205  normal  0.584575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2896  SOUL heme-binding protein  36.6 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2940  SOUL heme-binding protein  36.6 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2926  SOUL heme-binding protein  36.6 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824074  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2389  SOUL heme-binding protein  36.46 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3628  SOUL heme-binding protein  41.67 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146783  normal  0.903477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1732  SOUL heme-binding protein  35.58 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0388599  normal  0.579587 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2407  SOUL heme-binding protein  33.82 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2357  SOUL heme-binding protein  34.92 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2155  SOUL heme-binding protein  35.23 
 
 		 206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.798949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0124  SOUL heme-binding protein  33.71 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3219  SOUL heme-binding protein  36.76 
 
 		 214 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.918891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2884  SOUL heme-binding protein  35.32 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0215934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1349  putative SOUL heme-binding protein  29.95 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2804  SOUL heme-binding protein  33.52 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2566  SOUL heme-binding protein  32.66 
 
 		 198 aa  98.6  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0552192  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1785  SOUL heme-binding protein  31.68 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.216897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1935  SOUL heme-binding protein  35.45 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3007  SOUL heme-binding protein  34.24 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1762  SOUL heme-binding protein  36.21 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.744804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1033  SOUL heme-binding protein  36.96 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4115  SOUL heme-binding protein  34.39 
 
 		 209 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.721347  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0891  SOUL heme-binding protein  32.95 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0544  SOUL heme-binding protein  41.07 
 
 		 115 aa  84.3  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.301676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3441  SOUL heme-binding protein  33.51 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0854  SOUL heme-binding protein  30.81 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2304  SOUL heme-binding protein  28.57 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00025626  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37136  predicted protein  31.41 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1687  hypothetical protein  29.61 
 
 		 172 aa  71.2  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00350109 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40872  predicted protein  31.28 
 
 		 363 aa  68.6  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.471917 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1279  SOUL heme-binding protein  27.94 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4266  SOUL heme-binding protein  34.83 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.409144 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46002  predicted protein  26.5 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0390723  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35858  predicted protein  25.6 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000296008  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30678  predicted protein  27.68 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800735  normal  0.996732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>