More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0035 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  100 
 
 		 303 aa  600  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  72.55 
 
 		 306 aa  422  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  73.36 
 
 		 304 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  73.68 
 
 		 304 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  73.68 
 
 		 304 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  65.54 
 
 		 311 aa  371  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  65.13 
 
 		 303 aa  367  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  50.35 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  44.7 
 
 		 305 aa  262  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  45.42 
 
 		 306 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  46.46 
 
 		 302 aa  258  9e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  50.34 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  44.77 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  44.44 
 
 		 306 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  45.89 
 
 		 326 aa  255  6e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  44.92 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  44.63 
 
 		 312 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  45.45 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  47.54 
 
 		 304 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  41.58 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  41.97 
 
 		 310 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  44.37 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  40.82 
 
 		 334 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  46.44 
 
 		 338 aa  236  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  47.12 
 
 		 304 aa  235  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  44.3 
 
 		 302 aa  235  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  46.39 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  44.3 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  43.93 
 
 		 305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  41.45 
 
 		 324 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  40.19 
 
 		 311 aa  228  8e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  43.42 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  42.81 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  40.33 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  42.43 
 
 		 336 aa  226  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  43.09 
 
 		 329 aa  226  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  42.45 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  39.65 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  41.4 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  38.95 
 
 		 282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  40.07 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  37.68 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  41.16 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  35.92 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  36.81 
 
 		 289 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  37.1 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  35.96 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  34.39 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  35.76 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  34.67 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  34.27 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  35.07 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  33.1 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  35.23 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  35.23 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  34.33 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  34.03 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  37.15 
 
 		 289 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  34.81 
 
 		 286 aa  155  9e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  33.1 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  35.23 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  36.3 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  34.72 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  35.94 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  32.98 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  32.69 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  32.98 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  32.98 
 
 		 290 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  36.3 
 
 		 282 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  34.6 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  31.49 
 
 		 341 aa  152  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  32.89 
 
 		 302 aa  152  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  35.52 
 
 		 282 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  35.69 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  33 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  35.52 
 
 		 289 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  35.52 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  35.52 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  35.52 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  32.28 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  31.16 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  33.23 
 
 		 312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  30.31 
 
 		 287 aa  145  6e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  33.9 
 
 		 293 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  35.53 
 
 		 318 aa  145  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  35.44 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  35.79 
 
 		 918 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  32.29 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  34.4 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  31.94 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  29.33 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  32.4 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  32.98 
 
 		 286 aa  139  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  32.19 
 
 		 291 aa  132  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  31.58 
 
 		 286 aa  132  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  31.65 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  31.65 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  42.29 
 
 		 235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  30.48 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  28.42 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>