More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0026 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 213 aa  423  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.5 
 
 		 211 aa  230  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.02 
 
 		 212 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.41 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  31.08 
 
 		 223 aa  99  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.12 
 
 		 211 aa  95.1  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  26.17 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  31.8 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3754  hypothetical protein  34.85 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  26.17 
 
 		 211 aa  88.2  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  26.17 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  31.75 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  26.17 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  26.17 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  26.17 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  27.88 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0679253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  35.12 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  26.17 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  32.16 
 
 		 282 aa  84.7  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.66 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  32.14 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  27.62 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  28.26 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  30.85 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  30.2 
 
 		 211 aa  72  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  23.71 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.72 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  26.46 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  30.85 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0815  putative NADH-flavin reductase-like protein  25.23 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  25.75 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.45 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.22 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4864  hypothetical protein  32.88 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.542639 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3807  hypothetical protein  32.88 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0422433 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  32.32 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  24.66 
 
 		 294 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 		 294 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  30.88 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  31.43 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  29.52 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  26.58 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  26.58 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  26.58 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  25.46 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  29.86 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6107  NmrA family protein  30 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2748  hypothetical protein  30.95 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  30.73 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  29.52 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  27.85 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  28.5 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  22.38 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  29.11 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 309 aa  57  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  21.9 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  29.35 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4454  hypothetical protein  28.72 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  26.21 
 
 		 297 aa  57  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  30.84 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  21.9 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  21.9 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.54 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.7 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  21.9 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  28.77 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  22.95 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  29.05 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 		 308 aa  55.1  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.77 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  26.57 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>