233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2485 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2485  protein of unknown function UPF0029  100 
 
 
204 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  47.06 
 
 
274 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  43.54 
 
 
242 aa  158  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  45.63 
 
 
211 aa  153  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  40.51 
 
 
203 aa  143  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  40.51 
 
 
203 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  40.51 
 
 
203 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1317  hypothetical protein  41.38 
 
 
208 aa  141  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000207664  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  40.51 
 
 
204 aa  141  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  40 
 
 
203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  42.47 
 
 
205 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  45.11 
 
 
204 aa  136  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  39.5 
 
 
204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  41.99 
 
 
204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  37.95 
 
 
203 aa  128  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  39.71 
 
 
204 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  0.0000000252745 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  37.93 
 
 
204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  53.97 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  39.71 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  53.12 
 
 
207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  39.22 
 
 
204 aa  125  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  38.69 
 
 
204 aa  124  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  34.8 
 
 
204 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  38.42 
 
 
204 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000169816 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  37.06 
 
 
204 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  38.28 
 
 
204 aa  123  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  43.01 
 
 
209 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  38.42 
 
 
219 aa  122  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  37.93 
 
 
204 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  35.68 
 
 
208 aa  121  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  35.35 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  37.44 
 
 
204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  38.56 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  42.27 
 
 
204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  35.68 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  47.69 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4192  hypothetical protein  40.39 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121716  normal  0.896932 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  39.36 
 
 
212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4371  hypothetical protein  40.39 
 
 
204 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4311  hypothetical protein  40.39 
 
 
204 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.36951 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  49.21 
 
 
204 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4215  hypothetical protein  40.39 
 
 
204 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000733457  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4133  protein of unknown function UPF0029  43.09 
 
 
204 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235776  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  46.46 
 
 
206 aa  115  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  40.34 
 
 
176 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03739  predicted elongation factor  43.09 
 
 
204 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4264  hypothetical protein  39.9 
 
 
204 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03688  hypothetical protein  43.09 
 
 
204 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  42.62 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  42.62 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  0.0000831038 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  42.62 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000121216  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  42.62 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  42.62 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000068448  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  41.03 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1571  hypothetical protein  38.14 
 
 
202 aa  112  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  30.73 
 
 
210 aa  112  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2535  hypothetical protein  38.5 
 
 
210 aa  108  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000701111  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  30.73 
 
 
213 aa  107  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  35.71 
 
 
194 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  31.84 
 
 
221 aa  107  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  37.68 
 
 
206 aa  106  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  35.71 
 
 
239 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  43.17 
 
 
195 aa  105  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  43.65 
 
 
207 aa  105  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  36.87 
 
 
210 aa  105  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  33.7 
 
 
213 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  41.98 
 
 
233 aa  104  8e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  35.45 
 
 
195 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  31.35 
 
 
211 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  31.89 
 
 
211 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  31.89 
 
 
211 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  31.89 
 
 
211 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  34.69 
 
 
204 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  41.8 
 
 
207 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  41.53 
 
 
208 aa  103  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  32.92 
 
 
197 aa  103  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  34.22 
 
 
195 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  30.81 
 
 
211 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  30.81 
 
 
211 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  30.81 
 
 
211 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  30.81 
 
 
211 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  30.81 
 
 
211 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  35.1 
 
 
211 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  31.76 
 
 
211 aa  102  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  42.11 
 
 
212 aa  101  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  35.05 
 
 
195 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  34.02 
 
 
195 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  35.05 
 
 
195 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  35.05 
 
 
195 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  32.5 
 
 
290 aa  101  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0605  hypothetical protein  51.26 
 
 
209 aa  101  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  35.94 
 
 
213 aa  101  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  41.88 
 
 
214 aa  100  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  34.78 
 
 
203 aa  100  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  33.51 
 
 
195 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  37.23 
 
 
206 aa  99.8  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  34.57 
 
 
194 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  32.97 
 
 
198 aa  99.8  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  40.88 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  34.76 
 
 
209 aa  99  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>