47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2460 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 270 aa  552  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3105  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.71 
 
 		 257 aa  222  6e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2599  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.5 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  42.8 
 
 		 262 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  42.26 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.14 
 
 		 256 aa  145  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  34.27 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.33 
 
 		 256 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  35.29 
 
 		 256 aa  122  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  32.84 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  30.2 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  31.91 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.75 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  28.74 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.2 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.08 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  23.68 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  27.84 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14000  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.47 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.50908  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.74 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  23.58 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  20.19 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  27.2 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.79 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  24.6 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  25.14 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  25 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  20 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  37.37 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  30.42 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  20 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  25.42 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1928  hypothetical protein  24.18 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  30.77 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  20.2 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  18.96 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  25.78 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  18.18 
 
 		 254 aa  49.7  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  25.7 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  25.59 
 
 		 243 aa  45.8  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.47 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  25.65 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  26.58 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  24.76 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.65 
 
 		 243 aa  42.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39360  Endonuclease IV  22.71 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.548212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  35.06 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>