More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2402 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1027 aa  2087    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  39.87 
 
 		 1050 aa  654    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  48.35 
 
 		 1089 aa  955    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  41.91 
 
 		 1174 aa  763    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  36.94 
 
 		 1232 aa  638    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  39.48 
 
 		 1082 aa  639    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  50.53 
 
 		 1033 aa  978    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  42.29 
 
 		 1032 aa  679    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  39.68 
 
 		 1089 aa  634  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  40.83 
 
 		 1078 aa  626  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  40.09 
 
 		 1001 aa  618  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  39.65 
 
 		 1062 aa  616  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  42.81 
 
 		 1075 aa  601  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  36.62 
 
 		 1161 aa  588  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  39.39 
 
 		 1067 aa  581  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  39.71 
 
 		 1132 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  41.42 
 
 		 1124 aa  538  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  61.28 
 
 		 1244 aa  530  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  59.72 
 
 		 1127 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  58.1 
 
 		 446 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  52.16 
 
 		 408 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  53.64 
 
 		 1156 aa  434  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  51.57 
 
 		 428 aa  436  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  50.97 
 
 		 414 aa  430  1e-119  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  49.16 
 
 		 411 aa  380  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  49.16 
 
 		 411 aa  376  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  39.95 
 
 		 414 aa  350  8e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1564  hypothetical protein  34.7 
 
 		 457 aa  201  7.999999999999999e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  27.34 
 
 		 724 aa  187  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1399  PHP-like protein  31.97 
 
 		 409 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  29.15 
 
 		 657 aa  185  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0764  phosphotransferase domain-containing protein  31.71 
 
 		 401 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.311457  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  28.03 
 
 		 768 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1094  phosphotransferase domain-containing protein  28.92 
 
 		 394 aa  169  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0508566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0852  phosphotransferase domain-containing protein  28.43 
 
 		 394 aa  168  4e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.017726  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0960  PHP domain protein  30.35 
 
 		 372 aa  166  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131519  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  26.7 
 
 		 634 aa  163  2e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2187  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.73 
 
 		 662 aa  163  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285249  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1845  UvrD/REP helicase  27.73 
 
 		 662 aa  163  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1296  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 		 373 aa  162  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51711 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1581  phosphotransferase domain-containing protein  28.67 
 
 		 394 aa  160  8e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1107  phosphotransferase domain-containing protein  28.06 
 
 		 393 aa  160  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1455  UvrD/REP helicase  25.15 
 
 		 715 aa  159  3e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  25.16 
 
 		 625 aa  157  9e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0178  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.6 
 
 		 796 aa  152  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.349073  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.34 
 
 		 734 aa  152  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1319  phosphotransferase domain-containing protein  25.17 
 
 		 424 aa  152  4e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.52 
 
 		 671 aa  151  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  26.03 
 
 		 726 aa  151  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2868  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.19 
 
 		 665 aa  150  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.68 
 
 		 768 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2919  UvrD/REP helicase  25.52 
 
 		 621 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  28.37 
 
 		 646 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2731  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.19 
 
 		 665 aa  149  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0779  UvrD/REP helicase  25.94 
 
 		 630 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  25.37 
 
 		 724 aa  148  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3739  UvrD/REP helicase  30.88 
 
 		 719 aa  148  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  29.17 
 
 		 712 aa  146  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  24.96 
 
 		 764 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1125  PHP-like  27.43 
 
 		 380 aa  144  7e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  29.18 
 
 		 787 aa  144  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  25.93 
 
 		 825 aa  144  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0233  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.92 
 
 		 639 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  27.29 
 
 		 620 aa  143  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  30.39 
 
 		 736 aa  142  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  23.56 
 
 		 735 aa  140  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3023  UvrD/REP helicase  26.99 
 
 		 706 aa  139  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  30.45 
 
 		 719 aa  138  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3000  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 731 aa  138  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.120838 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  26.53 
 
 		 714 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.4 
 
 		 709 aa  137  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  29.12 
 
 		 723 aa  137  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.16 
 
 		 715 aa  137  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  29.12 
 
 		 723 aa  137  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0786  UvrD/REP helicase  28.69 
 
 		 685 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.91065  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0943  UvrD/REP helicase  28.18 
 
 		 684 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0961  UvrD/REP helicase  27.2 
 
 		 679 aa  136  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3651  UvrD/REP helicase  31.74 
 
 		 641 aa  136  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00677749  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  23.19 
 
 		 742 aa  135  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  27.77 
 
 		 684 aa  135  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  29.13 
 
 		 688 aa  135  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1416  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.96 
 
 		 664 aa  135  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1948  phosphotransferase domain-containing protein  28.23 
 
 		 396 aa  134  6.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  29.16 
 
 		 682 aa  134  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  23.93 
 
 		 678 aa  134  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  28.92 
 
 		 742 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  26.44 
 
 		 807 aa  134  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.16 
 
 		 704 aa  134  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.13 
 
 		 699 aa  134  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1226  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  22.96 
 
 		 664 aa  134  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305357  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0621  ATP-dependent DNA helicase UvrD  22.71 
 
 		 691 aa  134  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.258916  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  29.77 
 
 		 659 aa  133  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0348  DNA helicase  23.05 
 
 		 698 aa  133  2.0000000000000002e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00900686  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2037  UvrD/REP helicase  24.71 
 
 		 850 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114912  normal  0.635195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  27.95 
 
 		 708 aa  133  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  27.04 
 
 		 731 aa  132  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  25.42 
 
 		 648 aa  132  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  30.05 
 
 		 728 aa  132  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  25.42 
 
 		 648 aa  132  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  27.36 
 
 		 724 aa  132  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>